在Mac OS Lion上為Python3構建numpy / scipy

Question

我不能讓Numpy或Scipy在MAC OSX Lion上使用Python3。

我已成功使用pip來安裝numpy，scipy和matplotlib，它們與Python2.7配合得很好，但是在Python3中輸入import numpy會導致No module named numpy 。 我已經嘗試直接下載源代碼，然后運行'python3 setup.py build'，但我得到了各種錯誤警告，一些紅色與fortran有關（例如'找不到可執行文件f95'）。 最終失敗的錯誤消息是'RuntimeError：Broken toolchain：無法鏈接一個簡單的C程序'，並且似乎與前一行'sh：gcc-4.2：command not found'有關。

Scipy網站建議c編譯器可能存在問題，但使用pip安裝python2.7時沒有出現同樣的問題。 我已按照網站上有關更改編譯器的說明進行操作，但這沒有任何區別。

我也試過從虛擬環境安裝：

mkvirtualenv -p python3.2 test1
pip install numpy

但這失敗了， Command python setup.py egg_info failed with error code 1 in /Users/Eddy/.virtualenvs/test1/build/numpy

我考慮過將python3設為默認值，然后我認為pip安裝可能會有效，但我不知道如何做到這一點。 有沒有人對我如何進行有任何建議？ 謝謝。

Answer 1

我遇到了同樣的問題scipy / sparse / linalg / dsolve / superlumodule.c ：268：9：錯誤：非空函數'PyInit _superlu'應該返回一個值[-Wreturn-type]

scipy郵件列表上有人建議如下：

what happens if you change the line 268 ( in scipy/sparse/linalg/dsolve/_superlumodule.c)

from 
return;

to 
return NULL;

果然它有效

Answer 2

我在這個問題上取得了一些進展，在Ned Deily的pythonmac郵件列表上得到了很多幫助。 我現在可以為python3構建numpy，但是scipy仍然無法構建。

要安裝numpy：scipy網站（http://www.scipy.org/Installing_SciPy/Mac_OS_X）建議使用三個類型命令解決C編譯器問題，但這些不夠用，還需要一個：

$ export CC=clang
$ export CXX=clang
$ export FFLAGS=-ff2c
$ export LDSHARED='clang -bundle -undefined dynamic_lookup \
-arch i386 -arch x86_64 -isysroot /Developer/SDKs/MacOSX10.6.sdk -g'

從源頭建設后應該工作。 詳情請見此處 。

構建scipy的問題：雖然我認為，我不知道這里的問題是什么，再次使用C編譯器。 以下是錯誤消息。 我非常感謝你對此事的任何想法。

謝謝，艾迪

錯誤消息：

compiling C sources 

C compiler: clang -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -DNDEBUG -g -O3 -isysroot /Developer/SDKs/MacOSX10.6.sdk -arch i386 -arch x86_64 -isysroot /Developer/SDKs/MacOSX10.6.sdk 

compile options: '-DNO_ATLAS_INFO=3 -DUSE_VENDOR_BLAS=1 -I/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include -I/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/include/python3.2m -c' 
extra options: '-msse3' 
clang: scipy/sparse/linalg/dsolve/_superlumodule.c 
In file included from scipy/sparse/linalg/dsolve/_superlumodule.c:18: 
In file included from /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:15: 
In file included from /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:17: 
In file included from /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1972: 
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include/numpy/npy_deprecated_api.h:11:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by #defining NPY_NO_DEPRECATED_API" [-W#warnings] 
#warning "Using deprecated NumPy API, disable it by #defining NPY_NO_DEPRECATED_API" 
 ^ 
scipy/sparse/linalg/dsolve/_superlumodule.c:268:9: error: non-void function 'PyInit__superlu' should return a value [-Wreturn-type] 
        return; 
        ^ 
1 warning and 1 error generated. 
In file included from scipy/sparse/linalg/dsolve/_superlumodule.c:18: 
In file included from /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:15: 
In file included from /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:17: 
In file included from /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1972: 
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include/numpy/npy_deprecated_api.h:11:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by #defining NPY_NO_DEPRECATED_API" [-W#warnings] 
#warning "Using deprecated NumPy API, disable it by #defining NPY_NO_DEPRECATED_API" 
 ^ 
scipy/sparse/linalg/dsolve/_superlumodule.c:268:9: error: non-void function 'PyInit__superlu' should return a value [-Wreturn-type] 
        return; 
        ^ 
1 warning and 1 error generated. 
error: Command "clang -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -DNDEBUG -g -O3 -isysroot /Developer/SDKs/MacOSX10.6.sdk -arch i386 -arch x86_64 -isysroot /Developer/SDKs/MacOSX10.6.sdk -DNO_ATLAS_INFO=3 -DUSE_VENDOR_BLAS=1 -I/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/lib/python3.2/site-packages/numpy/core/include -I/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.2/include/python3.2m -c scipy/sparse/linalg/dsolve/_superlumodule.c -o build/temp.macosx-10.6-intel-3.2/scipy/sparse/linalg/dsolve/_superlumodule.o -msse3" failed with exit status 1 

Answer 3

我有這個問題，其中一個排序了 - 不知道哪一個，但我包括兩個完整性：

1. 我在我的.bash_profile“export CC = gcc-4.2”中有這個，這可能是以前的OS X編譯問題的某種破解，我刪除了它。
2. 通過我的XCode安裝從這里https://github.com/kennethreitz/osx-gcc-installer/安裝了獨立的GCC

啟動一個新的終端窗口和pip install numpy工作正常