如何在 Mac Mountain Lion OS X v10.8 上使用 pip 安裝 Scipy

Question

我在 Mountain Lion 上使用 pip 安裝 Scipy 時遇到嚴重困難。 我試過了：

sudo pip install -e git+https://github.com/scipy/scipy#egg=scipy-dev

正如網絡上各個地方所建議的那樣。

這會導致錯誤，例如：

ld: library not found for -lgcc
lipo: can't figure out the architecture type of: /var/tmp//ccC2HLVs.out

以及錯誤之前的幾個警告（我認為不嚴重）。

有人有什么建議嗎？

Answer 1

Scipy 現在也可以通過自制水龍頭獲得。 如果您安裝了自制軟件：

brew tap samueljohn/python
brew install scipy

在此處查看更多信息： homebrew-python

Answer 2

Pip 通常在 OS X 上使用 scipy 有困難。 從源代碼安裝並非易事，因此我建議不要這樣做。 在 OS X 中，您有一些更好的選擇：

• Scipy superpack ，一堆預編譯的二進制文件
• Enthought Canopy （免費或其他）已經擁有您需要的一切（numpy、scipy、matplotlib 等）
• Anaconda ，一個免費的科學 python 發行版，可能包含你需要的所有包。
• MacPorts ，一個全面而靈活的包管理器，允許您安裝和維護 python 發行版
• Homebrew ，另一個流行的 OS X 包管理器

Answer 3

以下是在虛擬環境（Mac OS X 10.9.2 Mavericks）中安裝 matplotlib 和 scipy 對我有用的方法：

# See George's answer above
brew update
brew upgrade
brew install gfortran 

# See http://www.scipy.org/scipylib/building/macosx.html (the link Nathan Gould posted above)
export CXX=g++-5.1
export CC=gcc-5.1
export FFLAGS=-ff2c
sudo ln -s /usr/bin/gcc /usr/bin/gcc-5.1
sudo ln -s /usr/bin/g++ /usr/bin/g++-5.1

pip install matplotlib
pip install scipy

matplot lib 安裝很快，但是 scipy 花了很長時間。

Answer 4

只是為了補充@Anton I. Sipos 所說的話。 我安裝了 Enthought 包，但在升級它時遇到了問題，所以我決定使用Homebrew進行全新安裝。 不幸的是，僅僅執行點擊並安裝對我來說效果不佳。 因此，經過一番搜索，我在 GitHub 上發現了一個samualjohn解決並為我工作的問題：

brew remove python
rm -rf /Library/Python/2.7/site-packages # it's save to delete this!
brew install python
pip install nose
brew install numpy
brew install scipy

問題顯然是 Enthought 卸載說明未涵蓋的站點包中的沖突。

注意：我必須使用pip安裝matplotlib 。

Answer 5

我在 OSX 10.9 Mavericks 上安裝 scipy 時也遇到了類似的問題。 為我解決的問題如下：

sudo pip list

正在顯示 numpy，因此我這樣做了：

sudo pip install --upgrade numpy

然后

brew list

正在顯示 gfortran。 我確保我有最新版本

brew update
brew upgrade

但

sudo pip install scipy 

因奇怪的 fortran 錯誤而失敗。 因此，我將其卸載並重新安裝

sudo brew install gfortran
sudo brew uninstall gfortran

令我驚訝的是

sudo pip install scipy 

在那之后工作。

Answer 6

我最近也很難在 virtualenv 上安裝 scipy。 我的問題是沒有正確看到 gfortran。 我使用了 macports sudo port install gcc48並通過以下方式創建了一個指向 gfortran 的符號鏈接：

sudo ln -s /opt/local/bin/gfortran-mp-4.8 /opt/local/bin/gfortran

之后， pip install scipy在我的 virtualenv 上運行沒有任何錯誤。

Answer 7

使用 pip 在 Mac OS X 上安裝 scipy 是可能的！ 您將需要系統上正確的 C 和 Fortran 編譯器來設置 scipy。 此頁面應該可以幫助您：

http://www.scipy.org/scipylib/building/macosx.html

完成此操作后，您應該可以使用pip install scipy進行安裝。

作為附加的故障排除說明，您可能需要創建指向編譯器的符號鏈接，以便安裝過程可以找到它。 以前的海報@biophetik 給出了一個如何做到這一點的例子。

另外，當我安裝 scipy 時，我已經在我的虛擬環境中安裝了 numpy。 我不確定一個是否/如何依賴另一個。

Answer 8

在 Mavericks 上，以下作品（可能也適用於其他版本）：

如果您還沒有，請安裝pip

sudo easy_install pip

然后安裝/更新scipy

sudo pip install scipy -U

出於某種原因pip將scipy安裝到

/Library/Python/2.7/site-packages/

並且不會刪除舊版本

/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7//Extras/lib/python/scipy/

因此，只需刪除舊版本即可。 打印版本號：

python -c "import scipy; print scipy.__version__"

Answer 9

我用 Mac OS El Captain 嘗試了一切：pip、ma​​cports、easy_install……。 唯一對我有用的是brew：

$ brew install scipy

之后，它會要求您按照以下說明進行操作：

$ brew link --overwrite numpy
$ mkdir -p /Users/adrieljr/Library/Python/2.7/lib/python/site-packages
$ echo 'import sys; sys.path.insert(1, "/usr/local/lib/python2.7/site-packages")' >> /Users/adrieljr/Library/Python/2.7/lib/python/site-packages/homebrew.pth