使用networkx添加邊緣

Question

是否有任何簡單的方法可以在networkx中將大量邊緣添加在一起

我想從列表中添加邊。

Answer 1

假設通過“將大量邊​​加在一起”，您的意思是從help(networkx.Graph) “將它們添加到圖形中”：

 |  **Edges:**
 |  
 |  G can also be grown by adding edges.
 |  
 |  Add one edge,
 |  
 |  >>> G.add_edge(1, 2)
 |  
 |  a list of edges,
 |  
 |  >>> G.add_edges_from([(1,2),(1,3)])

所以：

>>> import networkx as nx
>>> g = nx.Graph()
>>> g.add_edges_from([(0,4),(1,2),(2,3)])
>>> g
<networkx.classes.graph.Graph object at 0x1004b58d0>
>>> g.edges()
[(0, 4), (1, 2), (2, 3)]

我絕對建議養成閱讀交互式文檔的習慣。 我正在使用IPython ，因此，為了快速瀏覽可用方法，我要做的就是繪制圖形g ，然后鍵入g.[TAB] 。 這顯示了一個列表， g.add_edges_from是＃3。

OTOH，如果您只是想將兩個邊緣列表加在一起，也可以這樣做：

>>> g0.edges() + g1.edges()
[(1, 2), (2, 3), (3, 4), (1, 2), (2, 3), (3, 4), (5, 6)]
>>> set(g0.edges() + g1.edges())
set([(1, 2), (3, 4), (5, 6), (2, 3)])

Answer 2

圖形數據通常存儲在文件中，這使得使用Pandas數據框易於讀取。 例如，考慮為七年級學生網絡構建圖。 我們可以如下初始化圖形：

import pandas as pd
import networkx as nx

#read the edge list
edges = pd.read_csv('./data/moreno_seventh/out.moreno_seventh_seventh', skiprows=2, sep = " ", header=None)
edges.columns = ['student1', 'student2', 'count']

#read node metadata
meta =pd.read_csv('./data/moreno_seventh/ent.moreno_seventh_seventh.student.gender', header=None)
meta.index += 1
meta.columns = ['gender']

#construct the graph
G = nx.DiGraph()
for row in edges.iterrows():
    G.add_edge(row[1]['student1'], row[1]['student2'], count=row[1]['count'])

#add meta data
for i in G.nodes():
    G.node[i]['gender'] = meta.ix[i]['gender']