如何安裝沒有root權限的python包？

Question

我正在使用numpy / scipy / pynest在Mac OS X上進行一些研究計算。為了提高性能，我們從我們的大學租用一個400節點的集群（帶有Linux），以便可以並行完成任務。 問題是我們不允許在集群上安裝任何額外的軟件包（沒有sudo或任何安裝工具），它們只提供原始python本身。

如何在群集上運行我的腳本呢？ 有沒有辦法集成模塊（numpy和scipy也有一些我認為編譯的二進制文件），以便它可以解釋和執行而無需安裝包？

Answer 1

您不需要root權限即可在主目錄中安裝軟件包。 您可以使用諸如此類的命令來執行此操作

pip install --user numpy

或來自消息來源

python setup.py install --user

請參閱https://stackoverflow.com/a/7143496/284795

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第一種選擇更方便，所以如果服務器沒有pip或easy_install ，你應該禮貌地要求管理員添加它，向他們解釋好處（他們不會再被單個包的請求打擾）。

Answer 2

您可以通過virtualenv包創建虛擬環境。

這將創建一個文件夾（例如venv ），其中包含Python可執行文件的新副本和新的site-packages目錄，您可以在其中“安裝”任意數量的包，而無需任何類型的管理訪問。 因此，通過source venv/bin/activate環境將為Python提供一個相當於安裝這些軟件包的環境。

我知道這適用於SGE集群，但虛擬環境的激活方式可能取決於集群的配置。

您可以嘗試使用以下步驟在您自己的site-packages目錄中的群集上安裝virtualenv ：

1. 從這里下載virtualenv，把它放在你的集群上

2. 使用setup.py將其安裝到特定的本地目錄以充當您自己的站點包：

    python setup.py build python setup.py install --install-base /path/to/local-site-packages 

3. 將該目錄添加到PYTHONPATH：

    export PYTHONPATH="/path/to/local-site-packages:${PYTHONPATH}" 

4. 創建一個virtualenv：

    virtualenv venv 

Answer 3

您可以通過調用以下方法從任意路徑導入模塊：

sys.path.append()

Answer 4

Python Distribution Anaconda解決了這個問題中討論的許多問題。 Anaconda不需要管理員或root訪問權限，並且可以安裝到您的主目錄。 Anaconda附帶了許多有問題的軟件包（scipy，numpy，sklearn等等）以及conda安裝程序，如果需要額外的軟件包，還需要安裝額外的軟件包。

它可以從https://www.continuum.io/downloads下載