標簽[distance-matrix] - 堆棧內存溢出

[英]R package vegan stepacross function error

我正在嘗試在 R 的vegan package 中使用stepacross function。當我這樣做時，它會拋出錯誤並且無法運行代碼步進錯誤（distance.dat，路徑=“擴展”）：object 未找到“C_stepacross” 任何人都知道這是什么原因或如何解決它？我正在使用 R（6 ...

測量兩個公共 DNS 服務器之間的延遲（以毫秒為單位）

[英]Measure the latency in milliseconds between two public DNS servers

簡短介紹：我正在嘗試創建 DNS 服務器之間延遲的距離矩陣，以便使用矩陣分解來預測 p2p 延遲。要使用預測算法，我需要大約 20 台 DNS 服務器以及它們之間的延遲。服務器 DNS1 DNS2 DNS3 ... 客戶 1 DNS1 0 ？？ ... 平 DNS2 ？ ...

如何使用 seaborn 有效地 plot 距離矩陣？

[英]How can I efficiently plot a distance matrix using seaborn?

這個賞金已經結束了。此問題的答案有資格獲得+50聲望賞金。賞金寬限期在17 小時后結束。 JayJona想讓更多人關注這個問題。所以我有一個或多或少的 11.000 條記錄的數據集，有 4 個特征，它們都是離散的或連續的。我使用 K-means 執行聚類，然后使用 kmeans.labe ...

如何自動化 R 中的基本遺傳距離矩陣？

[英]How can I automate a basic genetic distance matrix in R?

我正在嘗試創建一種算法，該算法會從 dataframe 生成距離矩陣。這個想法是 dataframe 將包含三個或更多對齊的基因序列，算法將計算每個序列之間的差異數量並將其轉換為 dataframe。因此，輸入數據看起來像這樣：到目前為止，我有以下代碼來計算兩個序列（分類單元 1 和分類單元 ...

在 python 中將距離矩陣對導出到 .xlsx/.csv 中的列中

[英]Exporting distance matrix pairs into columns in .xlsx/.csv in python

可能是一個非常基本的導出，但我沒有設法提取距離矩陣中每個組合的值。創建距離矩陣的代碼非常基本，如下所示：產生一個形式的距離矩陣：我沒有找到以這種格式將其導出到 xlsx 或 csv 的方法：任何提示如何檢索每個組合的值？ ...

此處 Maps Calculate Matrix API 返回“請求缺少 app_id 和 app_code 參數。” 錯誤

[英]Here Maps Calculate Matrix API returns "The request is missing the app_id and app_code parameters." error

我正在嘗試使用以下調用使用 API 密鑰獲取起點-終點矩陣的距離：但它在響應詳細信息中返回此錯誤：“請求缺少 app_id 和 app_code 參數。它們必須作為查詢參數傳遞。如果您沒有 app_id 和 app_code，請通過您的客戶代表或在http ://developer.here. ...

從矩陣/列表創建距離矩陣

[英]Creating a distance matrix from a matrix/list

我從輸入中創建了一個列表，我也從列表中創建了一個矩陣。列表- 矩陣- 但是我想從上面的矩陣或列表創建一個距離矩陣，然后打印距離矩陣。實施它的正確方法是什么。在上面的矩陣中，前兩個節點代表起始節點和結束節點，第三個節點是距離。如果需要，我准備好進一步說明。樣本距離矩陣是 - ...

如何使用 OSMnx 從德國 OSM 數據高效地創建圖表？

[英]How to create a graph from German OSM data with OSMnx efficiently?

我目前正在處理包含德國郵政編碼的數據集。我的目標是計算每個郵政編碼區域中心之間的“真實”距離。為此，我首先從 geofabrik 下載了 germany-latest.osm.bz2 文件。接下來，我想從下載的文件中為 the.network_type = "driving" 創建一個圖表。 ...

Gowers 距離（Python Gower 包）矩陣在數據具有負值時顯示距離的負值

[英]Gowers distance (Python Gower package) matrix shows negative values for distance when data has negative values

我在 python - https://pypi.org/project/gower/ 中使用高爾 package 當我計算負值的高爾斯距離時，例如最低溫度，我得到一個負距離矩陣負值表示什么？這仍然是 0 和 1 之間的歸一化距離嗎？我可以像使用正值一樣使用這個距離的絕對值嗎？代碼 ...

將距離矩陣可視化為圖形

[英]Vizualize distance matrix into graph

對於跟隨距離矩陣我需要可視化下圖：這就是它的樣子我嘗試使用以下代碼 import networkx as nx import numpy as np import string dt = [('len', float)] A = np.array([ (0, ...

如何計算 PDB 文件中所有原子之間的距離並從中創建距離矩陣

[英]How to calculate the distance between all atoms in a PDB file and create a distance matrix from that

我想計算 pdb 文件中所有原子之間的距離，然后根據 PDB 的結果創建一個距離矩陣。我目前擁有所有 x、y 和 z 坐標，但我正在努力為所有原子進行這種距離計算。距離 = sqrt((x1-x2)^2+(y1-y2)^2+(z1-z2)^2) 例如： Atom 1 和 Atom 2,3,4 ...

用於 python 的 igraph package 是否包含計算圖距離矩陣的方法？

[英]Does the igraph package for python contain a method to compute the distance matrix of a graph?

igraph package 的 R 版本包含distances function ，根據文檔，它返回傳遞給它的圖形的距離矩陣。但是，我在 package 的 python 版本中找不到這個 function 或類似的。我能找到的唯一提供的 function 是Point.distance ...

ArcGIS中所有要素之間的距離矩陣

[英]Distance matrix between ALL features in ArcGIS

我在數據集中有 20 000 個多邊形。我需要所有多邊形之間的歐幾里德距離，因此一個 20 000 x 20 000 距離矩陣，其中對於每個多邊形，存儲到所有其他多邊形的距離。我在其他一些線程中閱讀了在 Arcmap 中使用“Near”工具的建議。但是，此工具僅計算到最近多邊形的距離，而我需 ...

如何使用python中的haversine庫計算大距離矩陣？

[英]How do I calculate a large distance matrix with the haversine library in python?

我有一個小集合和一大組位置，我需要知道這些集合中位置之間的地理距離。我的數據集的一個例子（它們具有相同的結構，但一個更大）：為了計算距離，我使用了hasrsine 庫。 hasrsine 函數希望輸入看起來像這樣：之后輸出如下所示：如何在不單獨添加所有位置的情況下使用我的兩個數 ...

在 Windows 中重新計算距離矩陣 python OSRM docker

[英]recalculate distance matrix python OSRM docker in windows

我是 python 編程的新手，請多多包涵，我已經通過在 Windows 機器中的 dockers 中運行的 OSRM 使用真實數據（lat & log）計算了距離矩陣（300x300）。完成計算大約需要 400 秒。因為矩陣會隨着客戶位置的增加而增加，所以我需要使用附加節點（附加 ...

在 Julia 中從三元組（obj、obj、距離/相似度）創建成對距離矩陣

[英]Creating a pairwise distance matrix in Julia from triplets (obj, obj, distance/simularity)

我有一個“obj obj distance”形式的矩陣，一個玩具矩陣看起來像這樣：我目前有一個解決方案：這實際上只是一個嵌套的 for 循環，它遍歷第一列，然后遍歷第二列。它輸出如下內容：但我認為有一種更快的方法，應該有一種方法可以使用索引來做類似的事情，不是嗎？我想我記得曾經 ...

根據距離矩陣找到每個元素與質心之間的距離？

[英]Find the distance between each element and the centroid based on distance matrix?

我有一個距離矩陣（元素之間的成對距離），我想找到集合的質心並獲得每個元素與質心之間的距離。我試圖使用 k-means 來做它並設置n_clusters=1 cluster_centers_返回一個坐標列表，但我不確定這是否代表每個元素和質心之間的距離。如果 k-means 不是解決這個 ...

將函數應用於數據幀子集的最佳方法是什么？

[英]What is the best way to apply a function to subsets of a dataframe?

我目前正在使用 NFL 數據集。該數據集非常細化，但非常簡單，每一行代表給定幀、給定游戲、給定游戲中玩家的位置（相對於場地的 x,y 坐標）。您可以將一幀視為時間快照，在該點上，我們記錄了場上所有球員的坐標，並將它們作為數據幀中每個球員的一行輸入。每場比賽大約有 70 幀，每場比賽有大約 80 ...

如何在 Spring 啟動應用程序中使用 DistanceMatrix Api

[英]How To use DistanceMatrix Api in Spring boot Application

我需要使用 DestanceMatrix API 來計算起點到終點之間的距離。誰能幫我在 spring 引導應用程序中實現此功能？提前致謝... ...

未捕獲的類型錯誤：嘗試查找距離矩陣 Javascript 時無法讀取未定義的屬性“應用”

[英]Uncaught TypeError: Cannot read property 'apply' of undefined when trying to find distance matrix Javascript

我試圖在谷歌地圖 API 中找到兩點之間的距離矩陣，我得到了這個錯誤。我試圖獲得距離矩陣響應，以便以英里為單位獲得距離。這是我擁有的代碼如果有人可以幫助我清除此錯誤，將不勝感激 ...