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我將如何進行元組解包，以便返回的變量根據二維網格中的最近鄰居進行配對？

[英]How would I do tuple unpacking such that the returned variables are paired based on being the nearest neighbor in a 2-D grid?

我正在探索您在下圖中看到的這些“神經元”之間的神經網絡模擬。 我遇到的困難是將每個神經元連接到最近的鄰居。 我首先想到我可以通過元組拆包來完成，但是它變得非常復雜。 在這個示例代碼片段中，元組解包被配置為使得第i個神經元連接到第i + 1個神經元，直到神經元n 。 當它到達神經元n時，第n個神經元 ...

如何在 NEURON 中創建突觸？

[英]How to create a synapse in NEURON?

如何使用其 Python 接口在 NEURON 模擬器中創建突觸？ 我想創建 2 個部分並將它們與突觸連接，但在Section API 或部分文檔中沒有任何功能：from neuron import h src = h.Section(name="source") dest = h.Sectio ...

在神經元模擬器中打開 .hoc 文件+“非機制”問題

[英]Opening .hoc files in neuron simulator + "not a mechanism" problem

我正在嘗試通過 python 運行 NEURON 模擬。 我按順序獲得了所有庫，並且能夠運行一些簡單的模擬，但是在使用更復雜的代碼時遇到了一些麻煩。 如果您有任何想法如何提供幫助，我將不勝感激 問題 1 ： 即使已編譯，Neuron 也不會打開.hoc文件的一部分。 我收到錯誤： 問題 2： ...

如何在 Ubuntu 中從 Neuron 7.6 升級到 7.7

[英]How to upgrade from Neuron 7.6 to 7.7 in Ubuntu

我尋找正在卸載的 NEURON 模擬器，我發現這篇文章建議刪除/usr/local/nrn 。 然后我重復安裝 7.7 版本的相同過程，但問題是我還有以前的版本。 我部分按照本教程在 Ubuntu 上安裝 package。 我使用 PIP 而不是 anaconda 來安裝 python 包。 你有 ...

奇點行為：shell vs exec

[英]Singularity behaviour: shell vs exec

因此，我正在嘗試調試在我有權訪問的 HPC 設置中遇到的錯誤。 我不會 go 詳細介紹錯誤，因為它是 package 特定的，我很確定這是一個環境變量類型的問題。 這就是說 package 是神經元，如果有人對它和奇點有經驗，我會很感激你的意見。 當我使用以下方法在本地測試所有內容時： 沒有問題。 ...

為什么在奇異容器中安裝主目錄會破壞 python 導入？

[英]Why does mounting the home directory in singularity container break a python import?

我一直在構建一個奇點容器來運行一些 python 代碼，盡管閱讀了奇點文檔，但我無法理解錯誤/行為。 首先，容器是從 docker 引導的 Ubuntu18.04，即： 我需要使用 python 模塊（神經元），需要事先編譯等。 我在定義文件的%post部分編譯代碼並添加環境變量： 我可以在沒有太 ...

在 Neuron 7.7 中，如何定義模擬的持續時間？

[英]In Neuron 7.7, how to define the duration of a simulation?

在 Neuron 7.5 中，我可以運行一個設置持續時間的模擬，如下所示： 在 Neuron 7.7 中，我收到以下錯誤： 使用dir似乎沒有使用的鍵仍在h庫中，這對於 2 個小版本顛簸（7.5 -> 7.7）來說似乎是一個非常劇烈的變化。 有誰知道如何在 7.7 版中執行此操作？ ...

你好在python中不斷增加輸入的實現

[英]Hello implementation of continuously increasing input in python

我有一個關於在 FitzHugh-Nagumo model 中展示神經元膜電位的程序中持續增加輸入的實現的問題。 我有 model 的結構，但我不知道如何實現不斷增加的輸入。 根據du/dt的解計算w w2 = b0+b1*v #根據dw/dt的解計算w plot 由 V 和 W 定義的線隨時間的 ...

Visual Studio 2019，Python和Neuron模擬器

[英]Visual Studio 2019, Python and Neuron simulator

我已經啟動並運行了Visual Studio Community 2019。 我正在嘗試將Python與NEURON（7.2.536.15）包一起使用。 我在Python 3.7（64位）環境中安裝了Neuron軟件包。 如何將神經元模擬器加載到我的Python應用程序中？ 命令：i ...

更改NEURON的mod文件中的單位

[英]changing units in mod files for NEURON

如何更改mod文件中的單位，以便在運行neuoConstract后可以保存單位？ 我曾嘗試使用Notepad ++進行更改，但是更改無法下次保存。 ...

MAC NEURON-Python：錯誤可以使用更新的命令行工具版本。 通過App Store中的軟件更新來更新它們

[英]MAC NEURON-Python: Error A newer Command Line Tools release is available. Update them from Software Update in the App Store

在嘗試使用Python支持安裝NEURON時（例如，可以運行python -c "import neuron" ），請使用Human Brain Project門戶網站上的說明 。 后： brew install neuron 我收到以下（誤導）錯誤： Error: A new ...

盡管不使用輸出，但仍需要存儲來自 Python 函數的輸出

[英]Storing output from Python function necessary despite not using output

我試圖理解為什么我必須存儲 Python 函數的輸出（無論我使用的變量名稱如何，也無論我隨后是否使用該變量）。 我認為這對 Python 更通用，而不是專門用於 NEURON 軟件，因此我把它放在 Stackoverflow 上。 感興趣的線路在這里： 如果我只編寫attach_current ...

Anaconda allensdk NEURON模型

[英]Anaconda allensdk NEURON model

我已經下載了艾倫神經元模型：Nr5a1-Cre VISp層2/3 473862496 使用所有必需的軟件包安裝Anaconda並安裝NEURON： https ://alleninstitute.github.io/AllenSDK/install.html 現在，我如何使用alle ...

艾倫大腦研究所 - 大腦觀察站示例

[英]Allen Brain Institute - brain observatory example

我正在嘗試遵循大腦天文台 ipython notebook的示例。 但是，我nwb加載如下所示的nwb文件。 所以，我通過HDFview打開了nwb文件。 除了502376461.nwb之外，所有的大腦天文台nwb文件都沒有打開。 它拋出了以下錯誤： 當我嘗試在 allen 的 ipy ...


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