Knitr不会将R输出注入到pandoc / markdown文档中

Question

我正在尝试使用knitr在pandoc/markdown文档中注入R代码及其输出。 但是我没有让knitr注入R输出。 我尝试用r and with {r}装饰R块。 两者都不起作用。 这是我的示例设置（带有```r）：

首先，我显示发出的命令，然后列出此命令随后使用的两个文件。

这是外壳程序的命令：

$ r CMD BATCH knitme.R

knitme.R含量：

library("knitr")
pandoc("foo.md")

foo.md内容：

# My knitr test

```r
1+1
```

Did this print *the result* as well?

Here a graph:

```r

plot(1:10)
```

And where is the graph?

运行命令后，确实得到了预期的新文件foo.html 。 这里是它的内容：

<h1 id="my-knitr-test">My knitr test</h1>
<pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span class="dv">1+1</span></code></pre>
<p>Did this print <em>the result</em> as well?</p>
<p>Here a graph:</p>
<pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r">
<span class="kw">plot</span>(<span class="dv">1</span>:<span class="dv">10</span>)</code></pre>
<p>And where is the graph?</p>

此结果表明pandoc转换了输​​入文件foo.md ，但* knitr没有注入执行R代码的输出。

我想念什么？ 任何帮助表示赞赏！

Answer 1

您应该首先在R Markdown （ *.Rmd ）文档上调用knit() ，该文档会生成Markdown（ *.md ）文档，并且此时可以运行pandoc() 。

library(knitr)
knit('foo.Rmd')
pandoc('foo.md')

片状网站上提到的示例084和088中的R脚本已经说明了如何。 还请查看Rmd文档，以了解R Markdown中R代码块的语法。 如果您还有5分钟的时间，请观看首页上的视频，我认为所有的困惑都应该消除。