在不同的R实例中运行R脚本文件夹

Question

我有一个需要运行的脚本文件夹，但是我需要并行运行它们。

如何运行一个R脚本文件夹，每个文件夹位于R的不同实例中？ 例如。 10个R脚本同时在10个R实例上运行。

以前我只是手动打开R十次，然后通过复制和粘贴来运行每个脚本，但是我想知道是否有一种方法可以使它自动化？

我不一定需要在R中执行此操作-我愿意使用其他语言。

Answer 1

这是仅R的解决方案，无论您使用哪种操作系统，都可以使用：

Rfiles <- dir("your.folder", pattern="\\.[R|r]$", full.names=TRUE)
library(parallel)
clus <- makeCluster(length(Rfiles))
parLapply(clus, Rfiles, source)

Answer 2

一个非常简单的方法来执行您正在描述的事情，是使用bash脚本，如下所示：

for R_FILE in $(ls *.R)
do
    R CMD BATCH $R_FILE &
done

如果您使用的是Windows，则需要安装Cygwin的东西，但是在Linux或Mac上，则可以使用。

Answer 3

您可以从外壳程序使用Rscript。 如何同时运行多个命令是特定于Shell的。 例如，这将适用于bash shell：

Rscript file1.R &
Rscript file2.R &