如何从 SLURM 中提交作业的位置查找？

Question

我通过 SLURM 向我们学校的 HPC 集群提交了几个作业。 因为 shell 脚本都具有相同的名称，所以作业名称看起来完全相同。 看起来像

[myUserName@rclogin06 ~]$ sacct -u myUserName
       JobID    JobName  Partition    Account  AllocCPUS      State ExitCode 
------------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------- 
12577766         run.sh    general ourQueue_+          4    RUNNING      0:0 
12659777         run.sh    general ourQueue_+          8    RUNNING      0:0 
12675983         run.sh    general ourQueue_+         16    RUNNING      0:0 

我如何知道提交作业是从哪个目录中提交的，以便区分作业？

Answer 1

您可以使用scontrol命令查看作业详细信息。 $ scontrol show job <jobid>

例如，对于 SLURM 集群上正在运行的作业：

$ scontrol show job 1665191
    JobId=1665191 Name=tasktest
    ...
    Shared=OK Contiguous=0 Licenses=(null) Network=(null)
    Command=/lustre/work/.../slurm_test/task.submit
    WorkDir=/lustre/work/.../slurm_test

您正在寻找最后一行WorkDir 。

Answer 2

最新版本的 Slurm 现在通过squeue提供该信息：

squeue --format "%Z"

根据手册页显示，

%Z    The job’s working directory.

Answer 3

为了列出不再通过squeue或scontrol访问的过去作业的工作目录，您可以使用sacct ：

sacct -S 2020-08-10 -u myUserName --format "jobid,jobname%20,workdir%70"

列出自 2020 年 8 月 10 日以来用户myUserName的所有作业的作业 ID、作业名称和工作目录。