导入pandas.rpy.common时Python中的分段错误11

Question

我正在运行Mountain Lion，它默认安装了Python 2.7.2。 我使用这个版本的Python建立了一个新的虚拟Python环境。 我使用pip install安装了一些软件包，例如numpy，matplotlib，ipython和其他一些软件包。 我一直在尝试开发一个脚本来从R加载数据，所以我也安装了rpy2。 当我在终端中启动Python时，我可以导入所有已安装的软件包（例如numpy，matplotlib等）并且没有问题。 但当我进入时：

import pandas.rpy.common as com

要么

import rpy2.robjects as objects

然后从Python exit() ，报告了一个分段错误11。 这可能不是一个问题，因为我在Python提示符下单独输入每个命令，因为命令似乎正常工作。 但是，我无法将命令作为较长脚本的一部分运行，因为错误似乎会导致脚本过早停止。

安装的pandas版本为0.14.1（之前为0.14.0 - 同样的问题）。 R的版本是3.1.1。 我尝试重新安装R并使用所有软件包的新安装重新创建新的虚拟环境。

关于由小牛队引入的变化引起的分段错误11的讨论很多。 但是，我认为这些问题不应影响Mountion Lion。 我们将非常感激地收到任何建议。

Answer 1

在安装了系统R的机器（例如，使用RStudio）和安装在环境（例如conda）中的rpy2的情况下，使用系统，并且可能与构建的rpy2不兼容，导致seg故障。 要诊断您是否有rpy2与其相同的R版本，请运行：

import rpy2
for row in rpy2.situation.iter_info():
    print(row)

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