在列表上使用reshape2 :: melt时如何指定关卡名称？

Question

题

我发现自己使用reshape2::melt从data.frame对象的层次结构list中获得单个“长” data.frame 。 但是，结果的列名称具有标记为“ L1”，“ L2”等的列表层次结构级别。但是，由于这些级别具有含义，因此我想给这些列取有意义的名称。 最好的方法是什么？ 可以使用单个调用melt吗？

我不愿意melt或reshape2 ，因此我愿意接受其他方法或包装。

当前设置

假设我们有一个data.frame对象的分层列表，如下所示：

library(reshape2)
x <- structure(list(cyl_6 = structure(list(gear_3 = structure(list( mpg = 1:2, qsec = 3:4), .Names = c("mpg", "qsec"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame"), gear_4 = structure(list(mpg = 5:6, qsec = 7:8), .Names = c("mpg", "qsec"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame")), .Names = c("gear_3", "gear_4")), cyl_8 = structure(list(gear_3 = structure(list(mpg = 9:10, qsec = 11:12), .Names = c("mpg", "qsec"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame"), gear_4 = structure(list(mpg = 13:14, qsec = 15:16), .Names = c("mpg", "qsec"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame")), .Names = c("gear_3", "gear_4"    ))), .Names = c("cyl_6", "cyl_8"))

当我使用melt(x) ，得到的列名是“ L1”作为气缸数，列名为“ L2”作为齿轮数。 我希望专栏分别说“ cylinders ”和“ gears ”。

mx <- melt(x)

这是head(mx)的输出。 我不希望它只说“ L1”和“ L2”：

1> head(mx)
  variable value     L2    L1
1      mpg     1 gear_3 cyl_6
2      mpg     2 gear_3 cyl_6
3     qsec     3 gear_3 cyl_6
4     qsec     4 gear_3 cyl_6
5      mpg     5 gear_4 cyl_6
6      mpg     6 gear_4 cyl_6

因此，我求助于手动设置“ L1”和“ L2”：

names(mx)[3:4] <- c("gears", "cylinders")

所需的输出

这是所需的最终列名称设置。 我希望能够实现此目标而无需手动重置mx的“名称”作为一个单独的步骤。

1> head(mx)
   variable value  gears cylinders
1       mpg     1 gear_3     cyl_6
2       mpg     2 gear_3     cyl_6
3      qsec     3 gear_3     cyl_6
4      qsec     4 gear_3     cyl_6
5       mpg     5 gear_4     cyl_6
6       mpg     6 gear_4     cyl_6

Answer 1

你可以试试

library(tidyr)
res <- unnest(x, sex)
head(res)
#   sex  Hair   Eye value
#1 MALE Black Brown    32
#2 MALE Brown Brown    53
#3 MALE   Red Brown    10
#4 MALE Blond Brown     3
#5 MALE Black  Blue    11
#6 MALE Brown  Blue    50

对于更新的问题，使用unnest并不容易。 需要重复呼叫“ unnest

library(dplyr)
dN <- unnest(lapply(x, unnest, gear), cylinders) %>%
                         gather(variable, value, mpg:qsec)
head(dN,3)
#  cylinders   gear variable value
#1     cyl_6 gear_3      mpg     1
#2     cyl_6 gear_3      mpg     2
#3     cyl_6 gear_4      mpg     5

Answer 2

library('reshape2')
x <- structure(list(cyl_6 = structure(list(gear_3 = structure(list( mpg = 1:2, qsec = 3:4), .Names = c("mpg", "qsec"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame"), gear_4 = structure(list(mpg = 5:6, qsec = 7:8), .Names = c("mpg", "qsec"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame")), .Names = c("gear_3", "gear_4")), cyl_8 = structure(list(gear_3 = structure(list(mpg = 9:10, qsec = 11:12), .Names = c("mpg", "qsec"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame"), gear_4 = structure(list(mpg = 13:14, qsec = 15:16), .Names = c("mpg", "qsec"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame")), .Names = c("gear_3", "gear_4"    ))), .Names = c("cyl_6", "cyl_8"))

从源代码的角度来看，L是经过硬编码的，因此您不能像现在这样在不做任何额外步骤的情况下即时更改它们。

reshape2:::melt.list
# function (data, ..., level = 1) 
# {
#   parts <- lapply(data, melt, level = level + 1, ...)
#   result <- rbind.fill(parts)
#   names <- names(data) %||% seq_along(data)
#   lengths <- vapply(parts, nrow, integer(1))
#   labels <- rep(names, lengths)
#   label_var <- attr(data, "varname") %||% paste("L", level, sep = "")
#   result[[label_var]] <- labels
#   result
# }

您可以做的就是稍微更改此函数并添加一个新参数，以便您可以根据需要命名它们：

meltList <- function (data, ..., level = 1, nn) {
  require('reshape2')
  '%||%' <- function (a, b) if (!is.null(a)) a else b
  parts <- lapply(data, melt, level = level + 1, ...)
  result <- plyr::rbind.fill(parts)
  names <- names(data) %||% seq_along(data)
  lengths <- vapply(parts, nrow, integer(1))
  labels <- rep(names, lengths)
  label_var <- attr(data, "varname") %||% paste("L", level, sep = "")
  result[[label_var]] <- labels
  if (!missing(nn))
    names(result)[grep('^L\\d+', names(result))] <- nn
  result
}

前

head(meltList(x, nn = c('gears','cylinders')))
#   variable value  gears cylinders
# 1      mpg     1 gear_3     cyl_6
# 2      mpg     2 gear_3     cyl_6
# 3     qsec     3 gear_3     cyl_6
# 4     qsec     4 gear_3     cyl_6
# 5      mpg     5 gear_4     cyl_6
# 6      mpg     6 gear_4     cyl_6

这也适用于更多嵌套列表：

y <- list(x = x, y = x)
head(melt(y))
#   variable value     L3    L2 L1
# 1      mpg     1 gear_3 cyl_6  x
# 2      mpg     2 gear_3 cyl_6  x
# 3     qsec     3 gear_3 cyl_6  x
# 4     qsec     4 gear_3 cyl_6  x
# 5      mpg     5 gear_4 cyl_6  x
# 6      mpg     6 gear_4 cyl_6  x

与

head(meltList(y, nn = c('gears','cylinders','variable')))
#   variable value  gears cylinders variable
# 1      mpg     1 gear_3     cyl_6        x
# 2      mpg     2 gear_3     cyl_6        x
# 3     qsec     3 gear_3     cyl_6        x
# 4     qsec     4 gear_3     cyl_6        x
# 5      mpg     5 gear_4     cyl_6        x
# 6      mpg     6 gear_4     cyl_6        x