Rcpp中的英特尔MKL SVD：结果不一致

Question

我编写了一个共享的C ++库，现在尝试使用.Call函数进行R扩展，以从该库中调用函数。 该函数使用英特尔MKL函数LAPACKE_dgesdd，该函数执行矩阵的SVD。

当我有一个大小为m = 5000且n = 8的矩阵时，R扩展和本机C ++版本的输出（U，S，V'矩阵）完全相同（小数点后15位）可能会期望。 但是，当m = 5000和n = 12时，R版本的输出不一致，它与本机C ++版本略有不同。 此外，每次运行它时，R版本都会为我提供稍有不同的输出（与n = 8一致的情况不同）。

我真的不知道如何解释这种奇怪的行为。 有人有想法吗？

代码如下：

function.cpp：

#include <iostream>
#include "mkl_lapacke.h"
#include "mkl.h"
#include <chrono>


  int testSvd(){
    int m=5000;
    int l=12;
    //Allocate matrices
    double * s2 = (double *)mkl_malloc( l*sizeof( double ), 64 );
    double * Rt2 = (double *)mkl_malloc( l*l*sizeof( double ), 64 );
    double * U_l2 = (double *)mkl_malloc( m*l*sizeof( double ), 64 );
    double * AQ2 = (double *)mkl_malloc( m*l*sizeof( double ), 64 );

    populate_matrix_random (m,l,AQ2); //Note that this populates AQ2 with the same matrix every time it is run

    //Perform the svd
    LAPACKE_dgesdd( LAPACK_ROW_MAJOR, 'S', m, l, AQ2, l, s2, U_l2, l, Rt2, l );

    for (int i=0; i<50; i++ ){
          printf( " %6.12f", U_l2[i] );
    }
    printf("\n\s:");
    for (int i=0; i<50; i++ ){
                    printf( " %6.12f", s2[i] );
    }
    printf("\n\Rt\n:");
     for (int i=0; i<50; i++ ){
                    printf( " %6.12f", Rt2[i] );
    }
 }

mainR.cpp：

#include "function.cpp"
#include <Rcpp.h>
RcppExport SEXP testSvdR() {
    testSvd();
}

然后是R代码：

library(Rcpp);
rm(list = ls())
dyn.load("/opt/intel/composer_xe_2015/mkl/lib/intel64/libmkl_rt.so",     local=FALSE);
dyn.load("mainR.so", local=FALSE);
result = .Call('testSvdR');

Answer 1

我通过在编译function.cpp时静态链接MKL解决了这个问题（之前我是动态链接的）。

我发现此链接也有帮助： https : //software.intel.com/zh-cn/articles/intel-mkl-custom-static-linkage

我不清楚在进行动态链接时为什么会有如此奇怪的结果。 我能想到的是，也许MKL的某些依赖项是从R自动加载的OpenBLAS或LAPACKE库中提取的。 我真的不知道。