如何从Python 3.4.2控制ImageJ

Question

我正在尝试使用Python 3.4.2来控制ImageJ

我想做的是从python代码开始，我想向imageJ发送命令以分析一些图像，检测边缘，对比度，噪点等，这里有一个类似的问题如何将ImageJ连接到python？ 但没有答案，例如“安装此程序，并使用此命令控制“查找边缘”按钮”

我不知道该怎么办，有人可以帮我吗

我找到了这个链接和这个链接 ，他们说可以通过使用“ import ij”来实现，但是没有我可以使用或安装的ij库。

ImageJ 网站也指出“如何从软件中调用ImageJ？” “如果您的软件是用另一种语言（如C或Python）编写的，则有很多方法可以集成Java功能。您必须选择最适合您的特定要求的Java。” 但没有细节

这个Google网页说，通过“ py4ij”，我可以使用python“ Py4IJ-用于ImageJ的Python-插件和IDE允许Python和Jython访问ImageJ”来控制imagej。

但我不确定如何运行，帮助

作为Imagej的替代品，是斐济，但我不确定python是否可以控制它，还是我必须使用Fiji和斐济教程

我的最后一个选择是使用OpenCV进行图像处理，但实际上我需要使用ImageJ或Fiji，因此OpenCV不是有效的答案

谢谢

编辑

根据第一个答案，它建议编写一个CellProfiler的RunImageJ模块，但是我的问题是我是否必须安装CellProfiler？ 从这里开始 ，遵循此处和此处的示例并运行模块

或者我应该遵循此链接中的原生Python想法

无论如何，第一个答案链接谈论的是Jython，但我不能使用Jython，它的最新版本基于python2.7，而我使用的是3.4，并且jython 3.x尚无开发

救命

Answer 1

最近在新的ImageJ论坛上讨论了Python与ImageJ的集成。 请参阅Python脚本编制线程。

虽然它专注于调用本机代码包装的Python模块，例如从ImageJ调用NumPy，但某些解决方案也解决了反向问题（从Python调用ImageJ），尤其是CellProfiler的RunImageJ模块。 如此处所讨论的，一个专门的程序员可以从那里开始，并为社区的利益拥护一个更通用的解决方案。

通常，此问题在Python页面的ImageJ Wiki上进行了讨论，尤其是关于局限性的部分 。