是否可以在 R 脚本中运行 CDO？

Question

我正在处理 netcdf 文件，并且我一直在使用 CDO 和 R 进行一些分析。我想知道是否可以在同一个脚本中直接从 R“调用”CDO . 我不确定如何（我一直在尝试使用 System() 来调用命令......但我不明白）。 任何人都有这个想法？ 可能吗？？

非常感谢提前

Answer 1

是的，使用 system() 函数，您可以在 R 常规例程中使用 bash（在 Linux 中）

例如，将 GRIB2 文件转换为 NetCDF 的简单代码

file_grb2 = "001.grb2"
file_ncdf ="001.nc"
system(paste("cd ~/DATA/prate; cdo -f nc copy ",file_grb2,file_ncdf,sep=(" ")))

Answer 2

除了使用系统函数，现在还有一个名为“ClimateOperators”的 R 包，它允许您直接从 R 中使用 CDO 和 NCO 操作符。这里是 github 存储库的链接：

https://github.com/markpayneatwork/ClimateOperators