从python运行shell脚本

Question

我编写了一个小的python程序，该程序编写了C-shell脚本，然后使用子进程调用该脚本。 但是，python无法执行脚本。 我在终端中对此进行了测试，发现脚本也不会从终端运行（即不是python问题）。 进一步的测试表明，我可以在文本编辑器（vi）中编写相同的脚本，然后从终端成功执行该脚本（即，我认为脚本的内容不存在问题）。 最终，我发现如果尝试使用./myscript.com直接在终端中运行python的输出，它将无法运行。 但是，如果我用vi打开，进行任何更改，保存，然后使用从终端运行./myscript.com （即相同的指令），它会执行。 该脚本包含在下面，以备使用，但是，大多数内容都非常特定于我要运行的特定程序。 我不知道如何进一步调试它，或者不知道为什么在vi中打开，保存和关闭的效果足以允许执行脚本。 （例如，我已经检查了权限，并且在vi步骤之后这些权限没有更改。）有关如何进行的任何建议都值得赞赏。

#!/bin/csh
#
bin2pipe -in /full/path/to/this/script/recon.spc -bad 0.0 -noswap \
-xN 1714 \
-xT 1714 \
-xFT Freq \
-xMODE Real \
-xSW 4184.570312 \
-xCAR 10.929523 \
-xOBS 800.130005 \
-xLAB 1H \
-yN 2048 \
-yT 2048 \
-yFT Freq \
-yMODE Real \
-ySW 1700.680054 \
-yCAR 125.728023 \
-yOBS 81.075996 \
-yLAB 1H \
-ndim 2 \
|nmrPipe -fn TP -auto \
|nmrPipe -fn REV \
|nmrPipe -fn TP -auto \
-out recon.spc.pipe.ft2 -ov -verb

Answer 1

如果这很有用，我可以使用xxd （如上述注释中的建议， http://linuxcommand.org/man_pages/xxd1.html ）将两个脚本文件（用python创建和一个手动编写）转换为十六进制

xxd script.txt output.txt

然后，我将两个文件的输出与diff并在文件末尾看到一个附加的十六进制字符0a 。 这对应于换行符。 如此处所述， 为什么文本文件应以换行符结尾？ VIM在文件末尾禁用自动换行符 ，如果没有， vi 在文件末尾添加换行符。 这使脚本可以运行。 最后没有换行符（我没有包含在python脚本中），该脚本将无法运行。