如何使用Process Builder从Java运行R脚本

Question

这应该很简单，但是我总是遇到错误。 我有一个秋千申请。 当用户按下按钮时，将提示他们选择要打开的R文件。 Rscript路径存储在用户首选项中。 然后，Processbuilder应该运行脚本：

Processbuilder的方法如下

 public static void open(File document) throws IOException, ScriptException {
        Preferences userPrefs = Preferences.userNodeForPackage(TBB_SQLBuilder.class);
        String pt=document.getAbsolutePath().toString().trim()   
        Process process = new ProcessBuilder(userPrefs.get("PathToR",null)+" '"+pt+"'").start();
  }

但是它给了我错误：

java.io.IOException: Cannot run program "/Applications/RStudio.app '/Users/sebastianzeki/Myscript.R'": error=2, No such file or directory

当我将R路径（在MacOSX ElCapitaine上）更改为/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/Resources/Rscript我得到了相同的错误

试图运行Runtime.getRuntime().exec(userPrefs.get("PathToR",null)); 也给我一个错误，但这一次是：

Cannot run program "/Applications/RStudio.app": error=13, Permission denied

但是当我使用Rscript时却不明白这一点。RStudio和Rscript的权限设置为所有人都能读写。

我想做的就是在R中运行我的脚本（这将输出一个csv，我的应用程序可以将其提取）

我知道Renjin（不支持dplyr），JRI和rJava（带有路径等的混乱安装）和RServe（只是不喜欢），因此将我的脚本作为外部脚本运行的Process Builder对我来说是最佳选择。

我究竟做错了什么？

Answer 1

ProcessBuilder的构造函数不采用命令行，而是采用命令及其参数。 因此，在此示例中，它应构造为

new ProcessBuilder(userPrefs.get("PathToR",null), pt);

该构建器将使用单个参数pt运行R 注意，即使pt包含空格，也将其解释为单个参数。