使用graph_from_data_frame在igraph中绘制孤立的节点。 失踪

Question

我正在使用具有“从”和“到”列的data.frames，我想从它们创建网络图。

例如：

mydata <- data.table(from=c("John", "John", "Jim", "Jesse"),
   to=c("John", "Jim", "Jack", NA))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=T)
plot(mygraph, vertex.label.dist=2) 

该NA的存在会产生错误。

如果仅删除NA行，则不会绘制孤独节点。

mydata <- data.table(from=c("John", "John", "Jim"),to=c("John", "Jim", "Jack"))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=T)
plot(mygraph, vertex.label.dist=2) 

我希望得到与以下结果相同的结果：

g4 <- graph( c("John", "Jim", "Jim",  "Jack", "John", "John"), isolates=c("Jesse") )  
plot(g4,  vertex.label.dist=2) 

但要使用两个列，从and到。 如何获得相同的结果？ 当“从”或“到”中的任何一个为NA时，只需绘制无边且无错误的节点即可。

Answer 1

一种获得所需内容的方法是忽略单个节点，然后使用add_vertices将其添加

library(igraph)
mydata <- data.frame(from=c("John", "John", "Jim"),
   to=c("John", "Jim", "Jack"))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=T)
mygraph = add_vertices(mygraph, 1, name="Jesse")
plot(mygraph, vertex.label.dist=2)