Spearman的相关性测试：“找不到对象”

Question

我使用R已有相当长的一段时间了，并用它来完成我硕士论文的所有统计。 在完成论文之前，我还有另外一件事要做，我无法弄清楚为什么R给我这样的代码。

我正在尝试运行Spearman的相关性测试，并将CSV文件附加到RStudio中。 这是我输入的代码，以及R给我的错误：

littersize=read.csv(file.choose())
littersize
cor.test(littersize, progesterone, method = "spearman")

cor.test.default中的错误（littersize，孕酮，方法=“ spearman”）：找不到对象“孕酮”

我之前已经获得了此代码，并且能够解决很多问题，但是由于某种原因，它只是无法正常工作。 我检查了拼写，检查了CSV文件中的错误，做了我能想到的一切。 谁能帮我弄清楚R想要我做什么？？？ 谢谢！

Answer 1

基于上面的代码（并且完全没有任何数据），很难说。

但是，您尚未将对象littersize 附加到rStudio工作空间中。

您已经在工作环境中加载了一个数据框，并littersize指定了名称littersize 。

如果您使用

search()

您会看到一份附件清单； 库，工具，您的GlobalEnv ... 如果 "littersize" 不在其中，则不附加。

这意味着您无法直接解决其中的列。

因此，如果progesterone是一littersize的列，则必须使用一种可接受的方法：

littersize$progesterone

要么

with(littersize, cor.test(progesterone, x, method="spearman"))

这里progesterone和x是两个字段，你正在寻找测试的相关性，这两者应该是在数据帧littersize如果要解决这种方式。 尚不清楚您的代码中是否有两个要比较的字段（在对象littersize中是否是一个名为littersize和一个progesterone ，还是分别加载了progesterone而不是说还是在关联一个变量？）。

如果它们位于不同的框架中，则必须明确地使用以下命令进行调用：

cor.test(littersize$progesterone, otherframe$x, method="spearman")

或附加两个对象并使用search()验证，然后直接使用字段名称

如果实际上文件大小为littersize而其中一列也为littersize ，则使用附加寻址可能会出现问题，因为您将附加两个具有相同名称的对象（框架和列）……在这种情况下，您应该明确要求$的列。

littersize$littersize

或者，您可以重命名附件文件，并且需要分离littersize因为在附件附加对象时不会对附件对象进行更改。您只需添加第二个新名称副本，而原始名称仍会挥之不去造成问题。

detach(littersize)

通常，最好不要附加文件，而是使用具有适当数据帧寻址的数据帧。 并且，如果可以的话，请创建命名范例，以帮助避免出现冗余的问题，例如：

• 数据框名称始终以大写Littersize

• 字段/列/变量名称为小写字母，并litter_size点划线或下划线： litter_size或littersize或litter.size

• 环境中的对象始终使用camelCase： litterSize

如果您对选择和使用名称的方式持一致态度，则可以在附加对象中进行冗余处理，但最好还是使用数据框并完全避免出现此问题。