networkx中邻接矩阵的路径

Question

我正在尝试使用networkx库将图形中的路径转换为邻接矩阵。 我可以将整个图转换为邻接矩阵：

>>>import networkx as nx
>>>DG=nx.DiGraph()
>>>DG.add_edges_from([(1,2), (2,3),(1,3)])
>>>nx.to_numpy_matrix(DG)
....matrix([[ 0.,  1.,  1.],
    [ 0.,  0.,  1.],
    [ 0.,  0.,  0.]])

但是，找到所有从节点1到节点3的简单路径后：

>>>list(nx.all_simple_paths(DG,1,3))
....[[1, 2, 3], [1, 3]]

我无法将它们转换为邻接矩阵。 我希望能够选择一条路径并将其转换为邻接矩阵，例如，第二条路径应返回：

....matrix([[ 0.,  0.,  1.],
    [ 0.,  0.,  0.],
    [ 0.,  0.,  0.]])

Answer 1

那不是邻接矩阵。 但是您可以轻松地自己构建它，如下所示：

import networkx as nx
import numpy as np

DG=nx.DiGraph()
DG.add_edges_from([(1,2), (2,3),(1,3)])
paths = list(nx.all_simple_paths(DG,1,3))

for path in paths:
    matrix = np.matrix(np.zeros((len(DG), len(DG))))
    for i in range(len(path)-1):
        matrix[path[i]-1], path[i+1]-1] = 1  # edit: credits to @Joel
    print(matrix)

输出：

[[ 0.  1.  0.]
 [ 0.  0.  1.]
 [ 0.  0.  0.]]
[[ 0.  0.  1.]
 [ 0.  0.  0.]
 [ 0.  0.  0.]]