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使用不同样本量的数据拟合 R 中的二项分布

[英]Fitting Binomial Distribution in R using data with varying sample sizes

我有一些看起来像这样的数据:

    x    y
1:  3    1
2:  6    1
3:  1    0
4: 31    8
5:  1    0
---

(编辑:如果有帮助,这里是 x 和 y 的样本向量

    x = c(3, 6, 1, 31, 1, 18, 73, 29, 2, 1)

    y = c(1, 1, 0, 8, 0, 0, 8, 1, 0, 0)

左侧 (x) 列是我的样本大小,右侧 (y) 列是每个样本中发生的成功次数。

我想使用二项式分布拟合这些数据,以便找到成功的概率 (p)。 到目前为止,我发现的所有拟合二项式分布的示例都假设所有数据点的样本大小 (n) 不变,但在这里我有不同的样本大小。

  1. 我如何将这些具有不同样本量的数据拟合为二项式分布? 期望的结果是 p,即在样本量为 1 时观察到成功的概率。

  2. 我如何使用 R 完成这样的拟合?

(编辑 #2:下面的响应概述了解决方案和相关的 R 代码,如果我假设每个样本中观察到的事件可以被假定为独立的,除了假设样本本身也是独立的。这适用于我的数据 - 谢谢! )

如何计算成功的经验概率

x <- c(3, 6, 1, 31, 1, 18, 73, 29, 2, 1)
y <-  c(1, 1, 0, 8, 0, 0, 8, 1, 0, 0)

avr.sample <- mean(x)
avr.success <- mean(y)

p <- avr.success/avr.sample
[1] 0.1151515

或者使用binom.test

z <- x-y # number of fails
binom.test(x = c(sum(y), sum(z)))
Exact binomial test

data:  c(sum(y), sum(z))
number of successes = 19, number of trials = 165, p-value < 2.2e-16
alternative hypothesis: true probability of success is not equal to 0.5
95 percent confidence interval:
0.07077061 0.17397215
sample estimates:
probability of success 
             0.1151515 

但是,这假设:

  1. 行对应的事件相互独立
  2. 同一行中的事件也是相互独立的

这意味着在实验的每次迭代k (即x行)中,我们执行一个动作,例如扔x[k]相同的骰子(不一定是公平的骰子),成功意味着获得一个给定(预定)的数字n 1:6 .

如果我们假设在每次迭代k抛出x[k]骰子时尝试获得1时获得上述结果,那么可以说获得1的经验概率为 (~) 0.1151515

最后,所讨论的分布将是B(sum(x), p)

PS:在上图中,骰子不仅在任何给定迭代中彼此相同,而且在所有迭代中都是相同的。

library(bbmle)

x = c(3, 6, 1, 31, 1, 18, 73, 29, 2, 1)
y = c(1, 1, 0, 8, 0, 0, 8, 1, 0, 0)

mf = function(prob, x, size){
  -sum(dbinom(x, size, prob, log=TRUE))
}

m1 = mle2(mf, start=list(prob=0.01), data=list(x=y, size=x))
print(m1)

系数:概率 0.1151535

对数似然:-13.47

暂无
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