尝试使用rpy2将pandas数据帧转换为R的数据帧时出现无符号整数错误

Question

我有以下数据：

grp_m1      grp_m2      grp_m3      grp_m4
$50-$75     $50-$75     $50-$75     $50-$75
$50-$75     $50-$75     $50-$75     $50-$75
$150-$175       $150-$175       $150-$175       $150-$175
$100-$125       $100-$125       $100-$125       $100-$125
$150-$175       $125-$150       $125-$150       $125-$150

然后将这些转换为假人。 这些傻瓜的 dtype 在pandas数据帧中是 unsigned int，当我尝试使用以下代码将其转换为 R 数据帧时：

from rpy2.robjects import pandas2ri
pandas2ri.activate()
pandas2ri.py2ri(data)

我收到以下错误：

Error while trying to convert the column "grp_m4_$175-$200". Fall back to string conversion. The error is: Cannot convert numpy array of unsigned values -- R does not have unsigned integers.
  (name, str(e)))
C:\Users\hduser\AppData\Local\Continuum\anaconda3.1\lib\site-packages\rpy2-2.9.1-py3.6-win-amd64.egg\rpy2\robjects\pandas2ri.py:61: UserWarning: Error while trying to convert the column "grp_m4_$200-$225". Fall back to string conversion. The error is: Cannot convert numpy array of unsigned values -- R does not have unsigned integers.
  (name, str(e)))

这可以修复还是我需要一起删除这些列，例如，如果出现此错误，只需跳过该列？

有人可以帮我解决这个问题吗？

Answer 1

您可以使用astype()从pandas以所有元素的转换在pandas数据帧所需dtype 。 在这种情况下，我们只想将您的虚拟变量转换为 R 理解的内容。 假设您的数据框仍命名为“data”，请尝试以下代码：

import pandas as pd

# change unsigned integers to integers
n_data = data.astype('int64') # you could also try float64, if you want

# Check data type
type(n_data.iat[0,0])

# Output
# <class 'numpy.int64'>

from rpy2.robjects import pandas2ri
pandas2ri.activate()

pandas2ri.py2ri(data)

Answer 2

马库斯的回答对我帮助很大。

在我的例子中，我认为这个问题的Pandas.DataFrame是numpy.uint8在被pd.get_dummies()转换为虚拟变量后被转换为pd.get_dummies() 。

因此，在应用pandas2ri.py2ri(data)之前，我只是通过astype()将其转换为'int64' ，最后我修复了该错误。