Rfast安装：/ usr / lib / R / etc / Makeconf：168：目标'Norm.o'的配方失败

Question

我正在尝试安装Rfast软件包。 它给了我以下错误，

/usr/lib/R/etc/Makeconf:168: recipe for target 'Norm.o' failed
    make: *** [Norm.o] Error 1

完整的错误信息是这样的，

> install.packages("Rfast", dependencies = TRUE)

* installing *source* package 'Rfast' ...
** package 'Rfast' successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
g++ -std=gnu++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG  -I"/home/haseeb/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" -I"/home/haseeb/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/RcppArmadillo/include"   -fopenmp -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-AitvI6/r-base-3.4.4=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c Diag.cpp -o Diag.o
g++ -std=gnu++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG  -I"/home/haseeb/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" -I"/home/haseeb/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/RcppArmadillo/include"   -fopenmp -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-AitvI6/r-base-3.4.4=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c Norm.cpp -o Norm.o
In file included from Norm.cpp:4:0:
templates.h: In function 'SEXPREC* eachrow_helper(SEXP, SEXP)':
templates.h:904:15: error: there are no arguments to 'DATAPTR' that depend on a template parameter, so a declaration of 'DATAPTR' must be available [-fpermissive]
   T *xx=(T *) DATAPTR(x),*xend=xx+ncol*nrow,*yy=(T *) DATAPTR(y),yvalue,*x3;
               ^~~~~~~
templates.h:904:15: note: (if you use '-fpermissive', G++ will accept your code, but allowing the use of an undeclared name is deprecated)
templates.h:904:55: error: there are no arguments to 'DATAPTR' that depend on a template parameter, so a declaration of 'DATAPTR' must be available [-fpermissive]
   T *xx=(T *) DATAPTR(x),*xend=xx+ncol*nrow,*yy=(T *) DATAPTR(y),yvalue,*x3;
                                                       ^~~~~~~
templates.h:905:32: error: there are no arguments to 'DATAPTR' that depend on a template parameter, so a declaration of 'DATAPTR' must be available [-fpermissive]
   RETURN_TYPE *m=(RETURN_TYPE*)DATAPTR(mat);
                                ^~~~~~~
/usr/lib/R/etc/Makeconf:168: recipe for target 'Norm.o' failed
make: *** [Norm.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package 'Rfast'

我的sessioninfo如下，

> sessionInfo()
R version 3.4.4 (2018-03-15)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.1 LTS

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.7.1
LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.7.1

locale:
 [1] LC_CTYPE=C                 LC_NUMERIC=C               LC_TIME=de_DE.UTF-8       
 [4] LC_COLLATE=C               LC_MONETARY=de_DE.UTF-8    LC_MESSAGES=C             
 [7] LC_PAPER=de_DE.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
[10] LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=de_DE.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.4 tools_3.4.4    yaml_2.2.0 

有谁可以帮助我解决此问题？

Answer 1

我相信问题是我忘记添加

#include <Rinlinedfuns.h>

但我无法使用此文件。 DATAPTR在此文件中声明。

Answer 2

我在运行Ubuntu 16.04的台式机和笔记本电脑上遇到了完全相同的错误，但不知如何解决。

对我来说，这似乎是一种不好的编码习惯（在没有事先声明的情况下使用DATAPTR（x）函数）。 我试图在头文件中找到DATAPTR的声明，但没有找到。

DATAPTR(x)在/usr/share/R/include/Rinternals.h定义，该文件未明确包含在Norm.cpp ，而在Diag.cpp包含，后者编译时没有错误。

我不知道为什么它会在其他机器上编译，而仅在我们的机器上失败。 g ++版本是：

g ++（Ubuntu 5.4.0-6ubuntu1〜16.04.10）5.4.0 20160609

我希望如果Rinternals.h没有明确包含在任何需要的地方DATAPTR那么它应该在所有的安装失败，除非在某种程度上有一种方法来指示编译器包括Rinternals.h默认？