虽然输出文件已经存在，但Snakemake想要运行作业

Question

我有一个工作流程，首先从公共数据库下载文件，然后在后续步骤中处理这些文件以创建多个聚合数据表。

我正在没有互联网连接的机器上测试工作流程。 我在另一台机器上运行了初步数据下载步骤并将它们复制到这台机器上，现在我正在尝试运行其余的工作流程。 当我运行snakemake -np它报告仍然需要完成所有数据下载作业，即使目标文件已经存在。 我甚至在后续处理规则中将这些文件标记为ancient() ，但这没有用。

我如何说服Snakemake这些工作不需要重新运行？

Answer 1

Flag --reason 打印每个执行规则的原因 。