使用具有cppyy的Eigen库

Question

我已经成功地使用cppyy为我正在研究的C ++项目进行自动python绑定。 我最近加入了Eigen库，但是我很难和cppyy一起使用它。 有没有人有这方面的经验，或者知道我应该怎么做？

我有回购的以下结构（仅显示相关部分）：

.
├── CMakeLists.txt
├── build
├── external
   ── eigen
├── include
   ── all .hpp files
├── src
   ── all .cpp files
├── python
   ── qmc.py

这里external/eigen是Eigen GitHub repo的副本。 qmc.py文件是cppyy魔法发生的地方，它看起来像这样（在尝试添加Eigen之前，这个工作正常）

import cppyy
import tempfile
import os
import glob

try:
    current_dir = os.path.dirname(__file__)
except NameError:
    current_dir = os.getcwd()
source_dir = os.path.dirname(current_dir)
install_dir = os.path.join(source_dir, 'build')
include_dir = os.path.join(source_dir, 'include')
eigen_dir = os.path.join(source_dir, 'external', 'eigen')
print(current_dir, source_dir, include_dir, install_dir)

def cmake_run(build_type='Release', c_compiler='gcc', cxx_compiler='g++'):
    os.environ['CC'] = c_compiler
    os.environ['CXX'] = cxx_compiler
    os.system('cd {} && cmake {} -DCMAKE_BUILD_TYPE={}'.format(install_dir, source_dir, build_type))

def load_library():
    os.system('cd {} && make engine'.format(install_dir))
    libraries = glob.glob(os.path.join(install_dir, 'libengine.*'))
    print('Found libraries: {}'.format(libraries))
    library = libraries[0]
    cppyy.load_library(library)
    for header in glob.glob(os.path.join(include_dir, '*.hpp')):
        print('Loading {}'.format(header))
        cppyy.include(header)

构建部分工作，但是一旦我尝试加载任何使用Eigen的头，我就会收到错误。 我已经尝试了所有我能想到的东西（逐个手动包含所需的标题，将整个库复制到构建目录等）但是无论我做什么，都会弹出相同类型的错误。 就像是

In file included from 
/path/to/repo/projects/include/myheader.hpp:3:10: fatal error: 'Eigen/Dense' file not found
#include <Eigen/Dense>
         ^~~~~~~~~~~~~

任何有关如何改变的帮助将不胜感激！

编辑 ：要清楚，构建步骤工作得很好，即代码编译，链接和运行应该。 使用cppyy加载库也有效。 问题是cppyy还需要包含头文件。 同样，这适用于我自己的标题，但它无法找到Eigen标题...

Answer 1

调用help（）时，有：

>>> import cppyy
>>> help(cppyy)
    """
    add_include_path(path)
        Add a path to the include paths available to Cling.
    """
>>>

因此，当eigen_dir是Eigen的路径时，这应该是票证：

cppyy.add_include_path(eigen_dir)

但是，有更好的方法，因为你已经使用了cmake。 请参阅此repo： https ： //github.com/jclay/cppyy-knearestneighbors-example 。 有了这个，自动加载应该工作。 也就是说，不需要在自己的代码中处理库和头文件。