需要帮助让bash / batch在Windows 10上适用于R

Question

我正在尝试使批处理模式在Windows 10上适用于R。最终目标是在外部服务器上批量运行某些R代码的许多迭代。

我在cmd提示符下成功安装了bash（Windows 10的unix包装器？）。 我正在研究有关使用批处理的教程。 我不确定是否要通过cmd或直接通过r代码运行它？ https://github.com/gastonstat/tutorial-R-noninteractive/blob/master/02-batch-mode.Rmd

通过本教程，我正在使用简单代码myscript1.R来测试批处理/重击。 然后，我输入到cmd promp / bash中的代码如下所示：

R CMD BATCH "F:/Google Drive/Documents/batch/myscript1.R" "F:/Google Drive/Documents/batch/myscript1-output.R"

目前，我在cmd / bash中获得的最接近的结果是在正确的文件夹中创建了一个输出文件，但空白，并且告诉我\\ usr \\ lib \\ R \\ bin \\ BATCH：无法创建myscript1-output.R：权限被拒绝。

我已经做了一切可能的事情，以允许所有用户拥有完全权限，并且不确定到底发生了什么。 谁知道如何在R for Windows中使用批处理模式或bash可以建议我吗？

谢谢

Answer 1

在这里感谢菲尔。 我不需要通过Ubunto使用“重击” ...我想。

相反，我只需要通过包含三个部分的常规cmd来调用CMD BATCH：

1. 我的R.exe目录：“ C：\\ Program Files \\ R \\ R-3.5.3 \\ bin \\ x64 \\ R.exe”（替换版本）
2. CMD批处理
3. 项目文件/脚本的目录：“ F：\\ project_folders_batch \\ myscript1.R”
4. 所需输出的目录（因此它并非默认为C / users / username）。 在这种情况下，我输出到与脚本相同的文件夹：“ F：\\ project_folders_batch \\ myscript1-output.R”

另外，如果要输出绘图或任何内容（我曾经），请在执行此操作之前将cd（更改目录）转到项目文件夹。 最终结果分两个步骤：

1. cd / d“ F：\\ projectfolder \\ batch”
2. “ C：\\ Program Files \\ R \\ R-3.5.3 \\ bin \\ x64 \\ R.exe” CMD批处理“ F：\\ projectfolder \\ batch \\ myscript1.R”“ F：\\ projectfolder \\ batch \\ myscript1-output.R “

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