[英]Is there any function that calculate correlation between a set of matrices included in an array in R?
我有一个包含 20 个矩阵的列表。 我想计算所有矩阵之间的皮尔逊相关性。 但我找不到任何可能的代码或功能? 你能否提供一些这样做的提示。
something like:
a=matrix(1:8100, ncol = 90)
b=matrix(8100:16199, ncol = 90)
c=matrix(sample(16200:24299),ncol = 90)
z=list(a,b,c)
我发现这个: https : //rdrr.io/cran/lineup/man/corbetw2mat.html并尝试一下:
library(lineup)
corbetw2mat(z[a], z[b], what = "all")
我有以下错误:
Error in corbetw2mat(z[a], z[b], what = "all") :
(list) object cannot be coerced to type 'double'
我想要一个这样的列表作为结果:
a & b
correlations
a & c
correlations
b & c
correlations
谢谢
我将创建一个较小的数据集来说明下面的解决方案。
要获得成对组合,最好的选择是使用combn
计算组合矩阵,然后循环遍历它,在这种情况下为lapply
循环。
set.seed(1234) # Make the results reproducible
a <- matrix(1:9, ncol = 3)
b <- matrix(rnorm(9), ncol = 3)
c <- matrix(sample(1:9), ncol = 3)
sample_list <- list(a, b, c)
cmb <- combn(3, 2)
res <- lapply(seq.int(ncol(cmb)), function(i) {
cor(sample_list[[ cmb[1, i] ]], sample_list[[ cmb[2, i] ]])
})
结果在列表res
。
请注意, sample
是一个基本的 r 函数,因此我将名称更改为sample_list
。
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