如何计算 object（变量）和 R 中的组（两个变量）之间的距离矩阵

Question

首先，我是 R 的新手，我正在尝试学习一些教程。 我陷入了一个关于距离矩阵的问题。 首先，我需要计算虹膜 dataframe 的列的距离矩阵。 我设法做到了。

data(iris)
data<-iris
iris_t<-data.frame(t(iris[,-5]
colnames(iris_t<-rownamens(iris)
dist<-dist(iris_t)
dist        

但是，现在我必须将最接近的Petal.Length和Sepal.Width视为一个组并重新计算距离矩阵，以便获得它们之间的距离。 我不知道该怎么做。

Answer 1

如果我让你正确：

D<-dist(t(iris[,-5]))
D = as.matrix(D)

您不需要重新计算，只需子集，距离不会改变：

D[c("Petal.Length","Sepal.Width"),c("Petal.Length","Sepal.Width")]
             Petal.Length Sepal.Width
Petal.Length      0.00000    25.77809
Sepal.Width      25.77809     0.00000

如果你想要它作为一个距离 object：

as.dist(D[c("Petal.Length","Sepal.Width"),c("Petal.Length","Sepal.Width")])
            Petal.Length
Sepal.Width     25.77809