用 R 过滤相关矩阵及其 p 值矩阵

Question

我有两个矩阵，一个带有相关统计数据，另一个带有 p 值，它们的维度为 942 x 942，我需要先过滤显着的 p 值（< 0.005），然后提取显着的相关性（> 0.60）。

我已经用下面的代码过滤了 p 值：

pvalues <- as.matrix (pvalues)
pvalues[pvalues > 0.05] <- NA

但是现在，我需要从另一个矩阵中提取统计数据和相同的对象，并且它必须超过 0.60。 有什么办法吗？

任何建议将不胜感激，非常感谢。

Answer 1

我融化了两个df

pvalues.melt <- melt(pvalues)
stats.corr.melt <- melt(stats.corr)

然后，我将 de stats 保存为向量并将该列添加到 p 值数据框中

stats <- as.vector(stats.corr.melt$value)
pvalues.stats <- cbind(pvalues.melt, stats)

然后，我过滤了两者。 首先，p 值 (<0.05)。

pvalues.filter <- filter(pvalues.stats, value < 0.05)

并且，接下来是统计数据（< -0.06 或 > 0.06）

stats.filter <- filter(pvalues.filter, stats < -0.6 | stats > 0.6)

剩下的就是将其转换回矩阵。