用 R 過濾相關矩陣及其 p 值矩陣

Question

我有兩個矩陣，一個帶有相關統計數據，另一個帶有 p 值，它們的維度為 942 x 942，我需要先過濾顯着的 p 值（< 0.005），然后提取顯着的相關性（> 0.60）。

我已經用下面的代碼過濾了 p 值：

pvalues <- as.matrix (pvalues)
pvalues[pvalues > 0.05] <- NA

但是現在，我需要從另一個矩陣中提取統計數據和相同的對象，並且它必須超過 0.60。 有什么辦法嗎？

任何建議將不勝感激，非常感謝。

Answer 1

我融化了兩個df

pvalues.melt <- melt(pvalues)
stats.corr.melt <- melt(stats.corr)

然后，我將 de stats 保存為向量並將該列添加到 p 值數據框中

stats <- as.vector(stats.corr.melt$value)
pvalues.stats <- cbind(pvalues.melt, stats)

然后，我過濾了兩者。 首先，p 值 (<0.05)。

pvalues.filter <- filter(pvalues.stats, value < 0.05)

並且，接下來是統計數據（< -0.06 或 > 0.06）

stats.filter <- filter(pvalues.filter, stats < -0.6 | stats > 0.6)

剩下的就是將其轉換回矩陣。