Plot 带有 numpy 数组错误的 NetworkX 图形

Question

我将邻接矩阵作为 numpy 数组，并希望将它作为使用 NetworkX 的简单无向图 plot，但我一直遇到此错误： AttributeError: module 'scipy.sparse' has no attribute 'coo_array'

我正在关注这个： Plot 来自邻接矩阵的 NetworkX Graph in CSV 文件特定的答案并且无法让它工作。 唯一的区别是我的邻接矩阵相当大，大约有 30000 列

这是我的图形绘制代码：

G = nx.from_numpy_matrix(np.matrix(adj_mtx_np), create_using=nx.DiGraph)
nx.draw(G)
plt.show()

我的scipy版本是1.8.0

Answer 1

将networkx降级到2.6.3，它为我解决了这个问题。

Answer 2

升级scipy和networkx ，它对我有用。

pip install --upgrade scipy networkx

Answer 3

我查看了生成该错误的 scipy 文件（“convert_matrix.py”）第 921 行：A = sp.sparse.coo_array((d, (r, c)), shape=(nlen, nlen), dtype=dtype ）。

您需要将“coo_array”切换为“coo_matrix”。

所以它应该看起来像： A = sp.sparse.coo_matrix((d, (r, c)), shape=(nlen, nlen), dtype=dtype)

这对我的项目来说足够好

Answer 4

我遇到了同样的问题，我用

pip install scipy==1.8.1

在 Windows 系统上，它工作。 我想这可能是因为以前版本的“scipy.sparse”没有“coo_array”。

我尝试了第一个答案中的方法，但它们不起作用。 我还尝试使用 conda 将 scipy 更新到 1.8.1 无济于事。

Answer 5

我也在 windows 10 中使用 vs 代码。我遇到了同样的问题。 然后我尝试分别升级 scipy 和网络，但它们对我不起作用。 然后我尝试使用以下代码升级两者。 那么这对我有用。

!pip install --upgrade scipy networkx

在cmd中，这段代码应该是这样的。 尝试以管理员身份打开。

pip install --upgrade scipy networkx

Answer 6

这些版本的 newtorkx 和 scipy 为我解决了错误

%pip install .networkx<2.7'

%pip install 'scipy>=1.8'