Matlab中的3D单元阵列

Question

我目前正在使用Matlab，我已将一个csv文件上传到一个名为B的单元格数组中。现在我要做的就是将B的信息输入一个3-D单元格数组中，即该数组的第3维。是B的第一列，其字符串从“ chr1”到“ chr24”。 B的全长为m，任何“ chr”的最大长度为maxlength。 我怀疑这是最好的解决方法，但这是我的代码：

for j = 1:m ,
 Ind = findstr(B{1}{j}, 'chr');
 Num = B{1}{j}(Ind+3:end-1);
 cnum = str2num(Num);
for i = 1:24,
    if cnum == i; 
        for k = 2:9 ,
            for l = 1:maxlength ,

            C{l}{k}{i} = B{k}{j};

            C{l}{k}{i}
            end
         end   
      end
   end
end

由此产生的3-D数组与初始数组中的相应值不匹配。 我也想知道这是否是创建3-D数组的正确方法，我似乎在matlab网站上找不到关于它们的任何信息。 谢谢

Answer 1

您的方法可能存在一些问题：首先，Matlab索引不同于对表的C样式索引。 myCell{i}{j}是单元格数组myCell的第i个元素中包含的单元格数组的第j个元素。 如果要索引到myCell{i,j}单元格数组中，则将在第i行第j列中的元素内容为myCell{i,j} 。

如果您的.csv文件的第2列到第9列包含所有数值数据，则可以更方便地使用一维单元格数组每个染色体的条目，或者使用2D或3D数字数组（如果有），对于每个染色体，分别为一行或一张表格。

这是一种方法

%# convert chromosomes to numbers
chromosomes = B{1};
chromosomes = strrep(chromosomes,'X',25);
chromosomes = strrep(chromosomes,'Y',26);
tmp = regexp(chromsomes,'chr(\d+)','tokens','once');
cnum = cellfun(@(x)str2double(x{1}),tmp);

%# catenate the rest of B into a 2D cell array
allNumbers = cell2mat(cat(2,B{2:end}));

%# now we can make a table with [chromosomeNumber,allOtherNumbers]
finalTable = [chromosomeNumber,allNumbers]

%# alternatively, if there are multiple entries for each chromosome, we can
%# group the data in a cell array, so that the i-th entry corresponds to chr.i
%# for readability, use a loop
outputCell = cell(26,1); %# assume 26 chromosomes
for i=1:26
    outputCell{i} = allNumbers(cnum==i,:);
end

Answer 2

我已经设法仅使用两个for循环来执行此操作，这是我的代码：

C = zeros(26,8,maxlength);
next = zeros(1,26);

for j = 1:m ,
 Ind = findstr(B{1}{j}, 'chr');
 Num = B{1}{j}(Ind+3:end-1);
 cnum = str2num(Num);
 if Num == 'X'
 cnum = 25;

 end
 if Num == 'Y'
 cnum = 26;
 end 
 next(cnum) = next(cnum) + 1;
 for k = 2:9 ,


      D{cnum}{k-1}{next(cnum)} = B{k}{j};
      C(cnum,k-1,next(cnum)) = str2num(B{k}{j});


 end   

end