使用因子“”删除 dataframe 中的行

Question

我有一个 dataframe 像 x 列基因是一个因素。 我想删除列基因没有的所有行。 所以在表 XI 中要删除第 4 行。对于大型 dataframe 有没有办法做到这一点？

X 
names   values   genes
1 A  0.2876113  EEF1A1 
2 B  0.6681894   GAPDH
3 C  0.1375420 SLC35E2
4 D -1.9063386        
5 E -0.4949905   RPS28

最终结果：

X 
names   values   genes
1 A  0.2876113  EEF1A1 
2 B  0.6681894   GAPDH
3 C  0.1375420 SLC35E2
5 E -0.4949905   RPS28

谢谢你们！

Answer 1

从您的问题中，空值是什么并不完全清楚，但您应该能够采用下面的解决方案（这里我假设“空”值是空字符串）：

toBeRemoved<-which(X$genes=="")
X<-X[-toBeRemoved,]

Answer 2

@Nick Sabbe 提供了一个很好的答案，但它有一个警告：

当只有几个元素要删除时，使用-which(...)是（有时）加速子集操作的一个巧妙技巧。

...但是如果没有要删除的元素，它就会失败！

因此，如果X$genes不包含任何空字符串， which返回一个空的 integer 向量。 否定它仍然是一个空向量。 X[integer(0)] 返回一个空的data.frame！

toBeRemoved <- which(X$genes=="")
if (length(toBeRemoved>0)) { # MUST check for 0-length
    X<-X[-toBeRemoved,]
}

或者，如果速度增益不重要，只需：

X<-X[X$genes!="",]

或者，正如@nullglob 指出的那样，

subset(X, genes != "")