使用因子“”刪除 dataframe 中的行

Question

我有一個 dataframe 像 x 列基因是一個因素。 我想刪除列基因沒有的所有行。 所以在表 XI 中要刪除第 4 行。對於大型 dataframe 有沒有辦法做到這一點？

X 
names   values   genes
1 A  0.2876113  EEF1A1 
2 B  0.6681894   GAPDH
3 C  0.1375420 SLC35E2
4 D -1.9063386        
5 E -0.4949905   RPS28

最終結果：

X 
names   values   genes
1 A  0.2876113  EEF1A1 
2 B  0.6681894   GAPDH
3 C  0.1375420 SLC35E2
5 E -0.4949905   RPS28

謝謝你們！

Answer 1

從您的問題中，空值是什么並不完全清楚，但您應該能夠采用下面的解決方案（這里我假設“空”值是空字符串）：

toBeRemoved<-which(X$genes=="")
X<-X[-toBeRemoved,]

Answer 2

@Nick Sabbe 提供了一個很好的答案，但它有一個警告：

當只有幾個元素要刪除時，使用-which(...)是（有時）加速子集操作的一個巧妙技巧。

...但是如果沒有要刪除的元素，它就會失敗！

因此，如果X$genes不包含任何空字符串， which返回一個空的 integer 向量。 否定它仍然是一個空向量。 X[integer(0)] 返回一個空的data.frame！

toBeRemoved <- which(X$genes=="")
if (length(toBeRemoved>0)) { # MUST check for 0-length
    X<-X[-toBeRemoved,]
}

或者，如果速度增益不重要，只需：

X<-X[X$genes!="",]

或者，正如@nullglob 指出的那樣，

subset(X, genes != "")