无法在ubuntu 11.10中安装rdkit

Question

我花了很多时间尝试使用预编译版本的boost 1.49在ubuntu 11.10 for Python 2.7（rdkit_201106 + dfsg.orig.tar.gz）上构建RDKit。 我悲惨地失败了。

重复出错的错误发生在CMake GUI中：

 CMake Error at CMakeLists.txt:11 (install):

  install FILES given no DESTINATION!



  CMake Error at CMakeLists.txt:14 (add_pytest):


  Unknown CMake command "add_pytest".

有什么帮助吗？

解决了以前的问题，但现在我在运行python时遇到此错误，即使我按照安装过程安装了rdkit：

 from rdkit import Chem
 Traceback (most recent call last):
   File "<stdin>", line 1, in <module>
 ImportError: No module named rdkit

Answer 1

确保你设置了环境变量:(你可能需要用你拥有的东西来修复路径）：在mac上使用bash：

export RDBASE=/usr/local/share/RDKit
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/local/lib/python2.7/site-packages

您可能希望将这些行添加到bash脚本以自动执行该过程。

Answer 2

对于Ubuntu 12.04.2 LTS设置，这个环境变量适合我

export RDBASE=/usr/share/RDKit
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/lib/pymodules/python2.7