有沒有人嘗試在“小鼠”包中並行化多重插補？

Question

我知道Amelia R包為並行多重插補 (MI)提供了一些支持。 但是，對我的研究數據的初步分析顯示數據不是多元正態的，因此，不幸的是，我不能使用Amelia 。 因此，我改用針對 MI 的mice R包，因為該包可以對非多元正態數據執行 MI。

由於通過mice的 MI 過程非常緩慢（目前我使用的是 AWS m3.large 2 m3.large例），我開始懷疑是否可以並行化該過程以節省處理時間。 根據我的檢討mice文件和相應的JSS文件，以及mice的源代碼，看來目前包不支持並行操作。 這是可悲的，因為恕我直言，MICE 算法自然是並行的，因此，它的並行實現應該相對容易，並且會在時間和資源上產生顯着的經濟性。

問題：有沒有人嘗試在mice包中並行化 MI，無論是在外部（通過R並行工具）還是在內部（通過修改源代碼），結果是什么（如果有的話）？ 謝謝！

Answer 1

最近，我嘗試通過外部的mice包來並行化多重插補 (MI) ，也就是說，通過使用R多處理設施，特別是R基礎發行版標配的parallel包。 基本上，解決方案是使用mclapply()函數來分配所需 MI 迭代總數的預先計算份額，然后將結果估算數據合並到單個對象中。 在性能方面，這種方法的結果超出了我最樂觀的預期：處理時間從 1.5 小時減少到7 分鍾以下（！）。 那只是在兩個內核上。 我已經刪除了一個多級因素，但它應該沒有太大影響。 無論如何，結果令人難以置信！