igraph r估計大型網絡的網絡集中度度量需要多長時間

Question

我有300000個節點和800000個邊的網絡。 R中的igraph程序包需要多長時間才能計算每個節點的網絡集中度（包括緊密度和中間度）。

Answer 1

相鄰性和緊密性的運行時間都是二次的，因此隨着節點數量的增加而大大增加。 這些作者估計需要7,000秒才能計算出具有325,000條邊的圖的中間性。 具有80萬條邊的圖形將花費更長的時間。

igraph確實有大圖特殊功能- estimate_betweenness和estimate_closeness ，該手冊上說是不能在運行二次。 您定義一個截止值，這是將包含在計算中的最大路徑長度。 傳統上，中間性考慮任何長度的路徑。 定義一個截斷將大大減少運行時間：

> lg <- erdos.renyi.game(300000,800000,type="gnm")
> ptm <- proc.time()
> igraph::estimate_betweenness(lg, cutoff = 3)[1:10]
 [1]  29  12  14  90  29  98  69  48 200  86
> proc.time() - ptm
   user  system elapsed 
 27.605   0.327  30.113 

〜30秒 這是在雙核Macbook播放機上。 隨着截止值的增加，運行時間也會增加。

當然，要權衡的是，您要對每個節點的中間度得分進行估算，而不是直接計算。

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參考：

Kang，U.，Papadimitriou，S.，Sun，J.，＆Tong，H.（2011年4月）。 大型網絡中的中心：算法和觀察。 在2011年SIAM數據挖掘國際會議論文集（第119-130頁）中。 工業和應用數學協會。 鏈接