僅對切出的簇而不是每片葉子繪制圖

Question

我有一棵有近2000個樣本的hclust樹。 我已將其切成適當數量的簇，並希望繪制樹狀圖，但最終以我切割簇的高度結束，而不是一直到每一片葉子。 每個繪圖指南都是關於通過群集或繪制一個框為所有葉子着色的，但是似乎沒有什么事情可以完全將切割線以下的葉子留下。

我的完整樹狀圖如下所示：

我想繪制它，仿佛它停止在此處我畫出abline的位置（例如）：

Answer 1

這應該使您入門。 我建議閱讀幫助頁面的“樹狀圖”

這是幫助頁面上的示例：

hc <- hclust(dist(USArrests))
dend1 <- as.dendrogram(hc)
plot(dend1)
dend2 <- cut(dend1, h = 100)
plot(dend2$upper)
plot(dend2$upper, nodePar = list(pch = c(1,7), col = 2:1))

通過對樹狀圖對象（不是hclust對象）執行切割，然后可以繪制樹狀圖的上部。 根據您的分析，將需要一些工作來替換branch1、2、3和4標簽。

祝好運。