在 R 中使用熱圖選擇觀察類別

Question

簡單的例子

library(heatmaply)
heatmaply(mtcars, k_col = 2, k_row = 3) %>% layout(margin = list(l = 130, b = 40))

我們得到了這個情節 我們看到觀察被分為 3 個集群

1 from honda civic to ferrari dino
2 from valiant to dodge challendger
3 from chrysler imperial to maserati bora

我們還看到技術參數（變量）分為兩類

The first class **hp** and **disp**
The second class another parameters

我如何在數據框中輸出這些觀察的名稱（或編號），一方面，它們在第一個集群（第一個集群的汽車）中，並且它們位於第一個技術變量集群的區域。 換句話說，我在下面的屏幕上確定了這個區域

因此，必須針對不同技術變量集群中所有汽車集群的觀察進行輸出。 很容易計算出它將是6個區域。

Answer 1

以下是使用 heatmapr（heatmaply 背后的函數）獲取相同內容的示例：

example_data <- mtcars # replace this with your data.
library(dendextend) # how to cite it, see citation("heatmaply")
x <- heatmapr(example_data ) 
library(dendextend) # how to cite it, see citation("dendextend")
data_groups <- cutree(x$rows, k = 3) # choose the k/number of clusters you see/want.
data_groups 

# This is how to see the groups of your data 
split(example_data, data_groups )

輸出將是：

$`1`
                mpg cyl  disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
Mazda RX4      21.0   6 160.0 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4
Mazda RX4 Wag  21.0   6 160.0 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4
Datsun 710     22.8   4 108.0  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
Merc 240D      24.4   4 146.7  62 3.69 3.190 20.00  1  0    4    2
Merc 230       22.8   4 140.8  95 3.92 3.150 22.90  1  0    4    2
Merc 280       19.2   6 167.6 123 3.92 3.440 18.30  1  0    4    4
Merc 280C      17.8   6 167.6 123 3.92 3.440 18.90  1  0    4    4
Fiat 128       32.4   4  78.7  66 4.08 2.200 19.47  1  1    4    1
Honda Civic    30.4   4  75.7  52 4.93 1.615 18.52  1  1    4    2
Toyota Corolla 33.9   4  71.1  65 4.22 1.835 19.90  1  1    4    1
Toyota Corona  21.5   4 120.1  97 3.70 2.465 20.01  1  0    3    1
Fiat X1-9      27.3   4  79.0  66 4.08 1.935 18.90  1  1    4    1
Porsche 914-2  26.0   4 120.3  91 4.43 2.140 16.70  0  1    5    2
Lotus Europa   30.4   4  95.1 113 3.77 1.513 16.90  1  1    5    2
Ferrari Dino   19.7   6 145.0 175 3.62 2.770 15.50  0  1    5    6
Volvo 142E     21.4   4 121.0 109 4.11 2.780 18.60  1  1    4    2

$`2`
                  mpg cyl  disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
Hornet 4 Drive   21.4   6 258.0 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1
Valiant          18.1   6 225.0 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1
Merc 450SE       16.4   8 275.8 180 3.07 4.070 17.40  0  0    3    3
Merc 450SL       17.3   8 275.8 180 3.07 3.730 17.60  0  0    3    3
Merc 450SLC      15.2   8 275.8 180 3.07 3.780 18.00  0  0    3    3
Dodge Challenger 15.5   8 318.0 150 2.76 3.520 16.87  0  0    3    2
AMC Javelin      15.2   8 304.0 150 3.15 3.435 17.30  0  0    3    2

$`3`
                     mpg cyl disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
Hornet Sportabout   18.7   8  360 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
Duster 360          14.3   8  360 245 3.21 3.570 15.84  0  0    3    4
Cadillac Fleetwood  10.4   8  472 205 2.93 5.250 17.98  0  0    3    4
Lincoln Continental 10.4   8  460 215 3.00 5.424 17.82  0  0    3    4
Chrysler Imperial   14.7   8  440 230 3.23 5.345 17.42  0  0    3    4
Camaro Z28          13.3   8  350 245 3.73 3.840 15.41  0  0    3    4
Pontiac Firebird    19.2   8  400 175 3.08 3.845 17.05  0  0    3    2
Ford Pantera L      15.8   8  351 264 4.22 3.170 14.50  0  1    5    4
Maserati Bora       15.0   8  301 335 3.54 3.570 14.60  0  1    5    8