如何在 ubuntu 上運行 R 文件？

Question

我嘗試使用以下代碼從服務器上的 ubuntu 終端運行 Rscript 文件：

Rscript etl/ConceptTables/loadTables.R mimiciii"

該文件位於下面的指定目錄中，但我需要從根目錄運行腳本。 但是，它說這個文件不存在，但它顯然存在。 我也嘗試通過首先進入 R 環境來運行它，但相反，我得到：

"Error: Unexpected symbol in "etl/ConceptTables/loadTables.R mimiciii"

我在這里遵循 github 上的這個模仿-omoop ETL 的說明： https://github.com/chichukw/mimic-omop/blob/master/README-run-etl.md我已經用我的用戶名和數據庫名稱。 誰能澄清我做錯了什么？

Answer 1

嘗試使用文件的完整路徑。 您發布的錯誤是“意外符號”

可能是因為您在 mimiii 的末尾添加了雙引號。 還是發布問題時出錯？

如果您對路徑使用雙引號，請確保它是“而不是”。