如何在使用 SimpleITK 保存 DICOM 文件時保留 UID？

Question

我正在嘗試使用 SimpleITK 讀取一個 DICOM 文件並將其保存在其他地方。 我注意到Series Instance UID發生變化，而不管我是否明確設置它。

如何保留原始 UID？

from pathlib import Path
import SimpleITK as sitk

dicom_path = '......'
p = Path(dicom_path)

reader = sitk.ImageFileReader()
reader.SetFileName(str(p))
reader.LoadPrivateTagsOn()

image = reader.Execute()
print('Series Instance UID', image.GetMetaData('0020|000e'))
print('SOP Instance UID', image.GetMetaData('0008|0018'))
image.SetMetaData('0020|000e', image.GetMetaData('0020|000e'))

writer = sitk.ImageFileWriter()
writer.SetFileName(out_folder+case+p.name)
writer.SetUseCompression(False)
writer.Execute(image)

reader = sitk.ImageFileReader()
reader.SetFileName(out_folder+case+p.name)
reader.LoadPrivateTagsOn()

image = reader.Execute()
print('Series Instance UID', image.GetMetaData('0020|000e'))
print('SOP Instance UID', image.GetMetaData('0008|0018'))

為系列 UID 提供兩個不同的字符串。 SOP UID 保持不變：

Series Instance UID 1.3.12.2.1107.5.1.4.74141.30000017013107011409700014483
SOP Instance UID 1.3.12.2.1107.5.1.4.74141.30000017013107011409700014570

Series Instance UID 1.2.826.0.1.3680043.2.1125.1.65790274925978549485969544082687134
SOP Instance UID 1.3.12.2.1107.5.1.4.74141.30000017013107011409700014570

Answer 1

雖然我從未使用過工具包，但工具包的行為很奇怪。 如果像素數據被修改，一些屬性應該被改變； 在這種情況下，SOP 實例 UID 是最重要的。

但是，在您的情況下，像素數據不會被修改。 此外，僅修改了系列實例 UID； SOP 實例 UID 不變。

無論如何，工具包提供了一種在編寫 DICOM 數據集時保留 UID 的方法。 請參閱KeepOriginalImageUIDOn成員了解更多詳情。

Self& itk::simple::ImageFileWriter::KeepOriginalImageUIDOn (void)
使用原始研究/系列/參考框架。

這些方法設置/獲取/切換傳遞給圖像文件的 itk::ImageIO 對象的 KeepOriginalImageUID 標志。 這僅與 DICOM 文件格式相關，將編寫器配置為使用圖像元數據字典中的信息或創建新的研究/系列/參考值框架。

在文件 sikImageFileWriter.h 的第 134 行定義。

這將指示工具包在寫入數據集時保留原始 UID。