[英]How to preserve UID while saving DICOM file using SimpleITK?
我正在尝试使用 SimpleITK 读取一个 DICOM 文件并将其保存在其他地方。 我注意到Series Instance UID
发生变化,而不管我是否明确设置它。
如何保留原始 UID?
from pathlib import Path
import SimpleITK as sitk
dicom_path = '......'
p = Path(dicom_path)
reader = sitk.ImageFileReader()
reader.SetFileName(str(p))
reader.LoadPrivateTagsOn()
image = reader.Execute()
print('Series Instance UID', image.GetMetaData('0020|000e'))
print('SOP Instance UID', image.GetMetaData('0008|0018'))
image.SetMetaData('0020|000e', image.GetMetaData('0020|000e'))
writer = sitk.ImageFileWriter()
writer.SetFileName(out_folder+case+p.name)
writer.SetUseCompression(False)
writer.Execute(image)
reader = sitk.ImageFileReader()
reader.SetFileName(out_folder+case+p.name)
reader.LoadPrivateTagsOn()
image = reader.Execute()
print('Series Instance UID', image.GetMetaData('0020|000e'))
print('SOP Instance UID', image.GetMetaData('0008|0018'))
为系列 UID 提供两个不同的字符串。 SOP UID 保持不变:
Series Instance UID 1.3.12.2.1107.5.1.4.74141.30000017013107011409700014483
SOP Instance UID 1.3.12.2.1107.5.1.4.74141.30000017013107011409700014570
Series Instance UID 1.2.826.0.1.3680043.2.1125.1.65790274925978549485969544082687134
SOP Instance UID 1.3.12.2.1107.5.1.4.74141.30000017013107011409700014570
虽然我从未使用过工具包,但工具包的行为很奇怪。 如果像素数据被修改,一些属性应该被改变; 在这种情况下,SOP 实例 UID 是最重要的。
但是,在您的情况下,像素数据不会被修改。 此外,仅修改了系列实例 UID; SOP 实例 UID 不变。
无论如何,工具包提供了一种在编写 DICOM 数据集时保留 UID 的方法。 请参阅KeepOriginalImageUIDOn
成员了解更多详情。
Self& itk::simple::ImageFileWriter::KeepOriginalImageUIDOn (void)
使用原始研究/系列/参考框架。这些方法设置/获取/切换传递给图像文件的 itk::ImageIO 对象的 KeepOriginalImageUID 标志。 这仅与 DICOM 文件格式相关,将编写器配置为使用图像元数据字典中的信息或创建新的研究/系列/参考值框架。
在文件 sikImageFileWriter.h 的第 134 行定义。
这将指示工具包在写入数据集时保留原始 UID。
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