如何在networkX中創建一個.gephi文件

Question

我無法從 Python 創建一個 .graph 文件，我唯一可以創建的是一個.gexf文件：

networkx.write_gexf(graph, "test.gexf")

它不適用於：

networkx.write_gexf(graph, "test.gephi")

Answer 1

根據networkX 文檔。 這個function的要點是：

將 GEXF 格式的 G 寫入路徑。

G是一個圖。

為了獲得.gephi文件，我建議使用 Gephi 打開從.gexf獲得的 .gexf 並保存為.gephi 。

圖片中的步驟（示例）：

1. 將您的圖表寫為.gexf文件：

some_graph = nx.path_graph(4)
nx.write_gexf(some_graph, "some_graph.gexf")

2. 打開Gephi和 select打開圖形文件... ：

3. Select文件>另存為...

4. 接下來，選擇文件格式：Gephi 文件 (*.gephi)

要記住的事情：

根據Gephi 快速入門教程：

保存您的項目 [as a.gephi 文件] 將所有數據和結果封裝在單個 session 文件中。

.gephi文件格式旨在用作“會話文件”，而不是用作 Gephi 的導入文件。

相反，Gephi 項目創建了一個特定的文件格式（ .gexf ）：

GEXF（Graph Exchange XML 格式）是一種用於描述復雜網絡結構、其相關數據和動態的語言。

（在此處查看有關此文件格式的更多信息）

在本質上...

如果您需要/想要將圖形保存為文件，請使用其中一種格式。
GEXF 始終是最自由的（允許更多功能）。

但是，如果您需要/想要在使用 Gephi 操作圖形后保存 session，請使用.gephi 。

另外，請考慮文件格式大小的差異：

對於我們上面的例子：

• GEFX 格式的原始圖形的大小為714 字節。
• 一個空白 session 與以 GEPHI 格式導入的相同 GEFX 圖的大小為8722 字節。