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Python:提高 class 中歐幾里得距離計算的速度

[英]Python: Improve the speed of Euclidean distance calculation in a class

我有一個 class 組件,用於計算 2 個字典中 arrays 中最后一個元素之間的歐幾里得距離。 一個字典包含 blob 的跟蹤軌跡( r ),另一個字典包含 blob 的更新值( b )。 class的方法基於歐幾里得距離尋找出現或消失的軌跡。 最后,他們將r字典重新排序為與b字典的最佳匹配。

我測試了這個colab 筆記本中的功能,它按預期工作,但是當我在我的代碼上實現它時,程序變慢了。

  1. 有沒有辦法可以提高這個 class 的速度?
  2. 有沒有更好的方法來解決這個問題? 它是什么?

謝謝你。

from scipy.spatial import distance as dist

class finder:

    def disappeared(self,r,b):
        values = {}
        indexes = {}
        diss = {}
        new_results = {}
        new_positions = {}

        le = len(r) - len(b)       

        for i in r:
            xr = r[i]["x"][-1]
            yr = r[i]["y"][-1]
            
            for k in b:
                xb = b[k]["x"][-1]
                yb = b[k]["y"][-1]
              
                D = dist.cdist([(xb,yb)],[(xr,yr)])
               
                values[str(i) +"/" + str(k)] = D
                indexes[str(i) +"/" + str(k)] = (i,k)

            if le > 0:
                le -= 1
                  
                maxval = max(values,key=values.get)
        
                r_ind = indexes[maxval][0]
                b_ind = indexes[maxval][1]

                print("Found Disappeared", maxval) 
  
                diss[r_ind] = r[r_ind]
            
            else:
                minval = min(values,key=values.get)
                r_ind = indexes[minval][0]
                b_ind = indexes[minval][1]
                new_positions[b_ind] = r[r_ind]
                
                del values[minval]
         
        for m,n in enumerate(new_positions):
            new_results[m] = new_positions[n]

        return(new_results,diss)

    def appeared(self,r,b):
        values = {}
        indexes = {}
        appr = {}
        new_results = {}
        new_positions = {}

        le = len(b) - len(r)       

        for i in b:

            xb = b[i]["x"][-1]
            yb = b[i]["y"][-1]

            for k in r:

                xr = r[k]["x"][-1]
                yr = r[k]["y"][-1]
              
                D = dist.cdist([(xr,yr)],[(xb,yb)])
               
                values[str(k) +"/" + str(i)] = D
                indexes[str(k) +"/" + str(i)] = (k,i)

            if le > 0:
                le -= 1
                  
                maxval = max(values,key=values.get)
        
                r_ind = indexes[maxval][0]
                b_ind = indexes[maxval][1]

                print("Found Appeared", maxval) 
  
                appr[b_ind] = b[b_ind]
                new_positions[r_ind] = b[b_ind]
            
            else:
                minval = min(values,key=values.get)
                r_ind = indexes[minval][0]
                b_ind = indexes[minval][1]
                new_positions[b_ind] = r[r_ind]
                
                del values[minval]
         
        for m,n in enumerate(new_positions):
            new_results[m] = new_positions[n]

        return(new_results)

大部分時間可能都花在訪問字典和格式化字符串上。

這里有一些你可以做的事情來優化disappeared()

只訪問b的值一次:

 # at start of function ...
 lastB = [ (k,v["x"][-1],v["y"][-1]) for k,v in b.items() ]

 ...

 for k,xb,yb in lastB:  # replaces for k in b: and the assignments of xb,yb
     
     ...

訪問r時獲取值和鍵:

 for i,v in r.items():
     xr = v["x"][-1]
     yr = v["y"][-1]

使用元組而不是字符串作為values ,您根本不需要indexes

 # index it with a tuple
 values[(k,i)]  = D
 
 ...

 # replace the whole maxval logic.
 r_ind,b_ind,_ = max(values.items(),key=lambda kv:kv[1])     

 ...

 # replace the whole minval logic.
 r_ind,b_ind,_ = min(values.items(),key=lambda kv:kv[1])
 ...
 del values[r_ind,b_ind]     

無需重新訪問每個鍵即可生成新結果:

 new_result = dict(enumerate(new_positions.values()))

可以對appeared()進行相同的改進,因為它幾乎是相同的。

這段代碼真的有效嗎? 這些行看起來完全錯誤:

       for i in r:
            xr = r[i]["x"][-1]
            yr = r[i]["y"][-1]

ir的元素。 您不會將其用作r的索引。 當然應該是:

       for i in r:
            xr = i["x"][-1]
            yr = i["y"][-1]

對於for k in b循環也是如此。

暫無
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