to_csv 的多個 dataframe 中的“AttributeError”

Question

我正在處理突變，它們分布在 22 個不同的文件中（僅使用 22 條染色體）。 當我保存這些文件並添加一列（命名為 chrom）時，我終於得到了多個數據框：

import pandas as pd
import os
import glob
path=os.getcwd()
files=glob.glob(path+"/*snp.txt")
li=[]

for file in files:
    df=pd.read_csv(file,index_col=None,names=["pos","ref","AA"], delim_whitespace=True)
    df['chrom']=os.path.basename(file)
    df['chrom']=df.chrom.apply(lambda x: x.replace('snp.txt',''))
    li.append(df)
    li.to_csv(f'chrom{li.iloc[4,0]}_snp.csv')

但是當我試圖將它保存在不同的數據框中時，我收到了這個警告：

Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 6, in <module>
AttributeError: 'list' object has no attribute 'to_csv'*

我嘗試使用dataframe=pd.DataFrame(li)但結果如下：

 89 pos  ref AA chrom 0 100...
90 pos ref AA chrom 0 100...
91pos  ref AA chrom 0 100...  

我如何轉換我的多個數據幀以將它們保存為多個 csv？ 我的意思是，將每個編輯的 dataframe 保存到不同的 csv 文件中。

編輯：我不需要 em 連接。

Answer 1

而不是li.to_csv()嘗試pd.concat(li).to_csv('path')