ggtree：如何以最簡單的方式生成 label 個樹枝

Question

我想 label 樹上的特定分支（例如，“第 1 組”），但我沒有找到特定的 function 來執行此操作。 有任何想法嗎？

set.seed(123)
tree <- rtree(30)
plot(tree)

Answer 1

您實際上並沒有在這里使用ggtree到 plot。 如果你想用ggtree繪制你的樹，你可以這樣做：

library(ggtree)
library(ggplot2)

set.seed(123)
tree <- rtree(30)

ggplot(tree) + 
  geom_tree() +
  geom_tiplab() +
  geom_text(aes(0.5, 20), label = 'Group 1', 
            check_overlap = TRUE, color = 'red', size = 6) +
  theme_void()