在Mac OS Lion上預裝python 2.6.7的numpy和scipy

Question

無論如何，Mac OS Lion隨附的python 2.6.7上是否要安裝numpy和scipy？ 我知道Lion也有Python 2.7。 但是我需要堅持使用Python 2.6，因為我使用的模塊在Python 2.7上不起作用。

Answer 1

Lion為其每個Python實現都提供了easy_install ： /usr/bin/easy_install-2.7針對/usr/bin/python2.7 ，以及2.6和2.5。

但是，scipy需要一個Fortran編譯器，而Lion並不附帶其中之一。 看起來您必須先安裝Fortran編譯器才能安裝numpy，否則以后將無法安裝scipy。

首先，您需要Xcode命令行工具。 （Apple經常更改此軟件包的名稱-取決於您的Xcode版本，它可能是“ Unix開發工具”或“ CLI開發工具鏈”等。）

這些可以由Xcode本身安裝。 如果您使用的是4.3.x，則從App Store安裝Xcode后，啟動它，轉到“首選項”，“下載”，“組件”，然后單擊“命令行工具”旁邊的“安裝”按鈕。 對於不同的版本，或者如果要在不使用Xcode的情況下安裝它們，則Homebrew頁（請參見下文）說明了如何獲取它們，或者可以在Apple的開發人員站點中瀏覽 。

如果您已經有了軟件包管理器（Homebrew，MacPorts或Fink），請使用它。 如果不這樣做，請安裝Homebrew ：

curl https://raw.github.com/gist/323731/25f99360c7de3f72027d8fd07cb369b1c8756ea6/install_homebrew.rb -o /tmp/install_homebrew.rb
ruby /tmp/install_homebrew.rb
rehash

然后像這樣安裝gfortran：

brew install gfortran

現在您已經准備安裝numpy和scipy。 如果您喜歡pip而不是easy_install（如果您不知道，則可能更喜歡pip），則必須先安裝：

sudo easy_install-2.6 pip

然后使用它來安裝軟件包：

sudo pip-2.6 install numpy

根據您的確切操作系統版本和其他詳細信息，您可能已經為2.6內置了一個numpy，但是該numpy不支持Fortran。 您可以這樣說是因為sudo pip-2.6 install numpy表示Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): numpy in /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python 。 解決方案是完全按照錯誤消息的說明進行操作：

sudo pip-2.6 install --upgrade numpy

最后：

sudo pip-2.6 install scipy

Answer 2

我在Mountain Lion上安裝SciPy時遇到了類似的問題。

OSX山獅10.8

Python 2.7.3

點1.1

釀造0.9.2

GNU Fortran（GCC）4.2.1

我收到的一些錯誤包括：

這個：

pip install scipy

產生此錯誤：

Could not locate executable pgfortran

don't know how to compile Fortran code on platform 'posix'

building 'dfftpack' library

error: library dfftpack has Fortran sources but no Fortran compiler found

這促使我尋找Fortran編譯器：

該命令：

brew install gfortran

產生此錯誤：

Error: Currently the gfortran compiler provided by this brew is only supports the following versions of XCode:

    - XCode 3.1.4 on OS X 10.5.x
    - XCode 3.2.2/3.2.3 -- 4.0 on OS X 10.6.x
    - XCode 4.1 or newer on OS X 10.7.x

The AppStore and Software Update can help upgrade your copy of XCode.
The latest version of XCode is also available from:

http://developer.apple.com/technologies/xcode.html

這使我想到了一個博客文章： http : //www.joewandy.com/ 。 我遵循了此建議：

該命令：

brew edit gfortran

將使用xcode打開文件。 我在兩個地方修改了該文件：

論文2行：

if MacOS.xcode_version >= '4.2' and MACOS_VERSION == 10.7
    ohai "Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666)"

變成：

if MacOS.xcode_version >= '4.2' and MACOS_VERSION >= 10.7
    ohai "Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666) or higher"

換一種說法：

將== 10.7更改為>= 10.7並將XCode 4.2 (build 5666)更改為XCode 4.2 (build 5666) or higher

然后我做了

brew install gfortran

再次。 消息成功：

Downloading http://r.research.att.com/tools/gcc-42-5666.3-darwin11.pkg

Already downloaded: /Library/Caches/Homebrew/gfortran-4.2.4-5666.3.pkg
==> Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666) or higher
==> Caveats
Brews that require a Fortran compiler should not use:

depends_on 'gfortran'

The preferred method of declaring Fortran support is to use:

def install
    ...
    ENV.fortran
    ...
end

==> Summary

/usr/local/Cellar/gfortran/4.2.4-5666.3: 86 files, 72M, built in 2 seconds

然后我做了：

pip install scipy

但這給了我這個：

#error "<vecLib/vecLib.h> is deprecated.  Please #include <Accelerate/Accelerate.h> and link to Accelerate.framework."

然后我找到了此博客文章：在Mountain Lion上編譯SciPy http://www.thisisthegreenroom.com/2012/compiling-scipy-on-mountain-lion/

表示要使用此命令：

pip install -e git+https://github.com/scipy/scipy#egg=scipy-dev

這大約需要5到6分鍾才能完成

Installed /Users/hernamesbarbara/src/scipy
Successfully installed scipy
Cleaning up...

之后我可以做

python


Python 2.7.3 (v2.7.3:70274d53c1dd, Apr  9 2012, 20:52:43) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import scipy
>>> help(scipy)

    Help on package scipy:

NAME
    scipy

成功！

已安裝SciPy版本：

full_version = '0.12.0.dev-14b1e07'
git_revision = '14b1e07602ff33a6e8250eb2bc7a6816677606a9'
release = False
short_version = '0.12.0'
version = '0.12.0.dev-14b1e07'

Answer 3

我認為您不需要安裝Brew和XCode，也不需要自己編譯gfortran：我從http://hpc.sourceforge.net安裝了gfortran的編譯版本，一切似乎都可以正常工作。 （我是10.7.5）