在Mac OS Lion上预装python 2.6.7的numpy和scipy

Question

无论如何，Mac OS Lion随附的python 2.6.7上是否要安装numpy和scipy？ 我知道Lion也有Python 2.7。 但是我需要坚持使用Python 2.6，因为我使用的模块在Python 2.7上不起作用。

Answer 1

Lion为其每个Python实现都提供了easy_install ： /usr/bin/easy_install-2.7针对/usr/bin/python2.7 ，以及2.6和2.5。

但是，scipy需要一个Fortran编译器，而Lion并不附带其中之一。 看起来您必须先安装Fortran编译器才能安装numpy，否则以后将无法安装scipy。

首先，您需要Xcode命令行工具。 （Apple经常更改此软件包的名称-取决于您的Xcode版本，它可能是“ Unix开发工具”或“ CLI开发工具链”等。）

这些可以由Xcode本身安装。 如果您使用的是4.3.x，则从App Store安装Xcode后，启动它，转到“首选项”，“下载”，“组件”，然后单击“命令行工具”旁边的“安装”按钮。 对于不同的版本，或者如果要在不使用Xcode的情况下安装它们，则Homebrew页（请参见下文）说明了如何获取它们，或者可以在Apple的开发人员站点中浏览 。

如果您已经有了软件包管理器（Homebrew，MacPorts或Fink），请使用它。 如果不这样做，请安装Homebrew ：

curl https://raw.github.com/gist/323731/25f99360c7de3f72027d8fd07cb369b1c8756ea6/install_homebrew.rb -o /tmp/install_homebrew.rb
ruby /tmp/install_homebrew.rb
rehash

然后像这样安装gfortran：

brew install gfortran

现在您已经准备安装numpy和scipy。 如果您喜欢pip而不是easy_install（如果您不知道，则可能更喜欢pip），则必须先安装：

sudo easy_install-2.6 pip

然后使用它来安装软件包：

sudo pip-2.6 install numpy

根据您的确切操作系统版本和其他详细信息，您可能已经为2.6内置了一个numpy，但是该numpy不支持Fortran。 您可以这样说是因为sudo pip-2.6 install numpy表示Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): numpy in /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python 。 解决方案是完全按照错误消息的说明进行操作：

sudo pip-2.6 install --upgrade numpy

最后：

sudo pip-2.6 install scipy

Answer 2

我在Mountain Lion上安装SciPy时遇到了类似的问题。

OSX山狮10.8

Python 2.7.3

点1.1

酿造0.9.2

GNU Fortran（GCC）4.2.1

我收到的一些错误包括：

这个：

pip install scipy

产生此错误：

Could not locate executable pgfortran

don't know how to compile Fortran code on platform 'posix'

building 'dfftpack' library

error: library dfftpack has Fortran sources but no Fortran compiler found

这促使我寻找Fortran编译器：

该命令：

brew install gfortran

产生此错误：

Error: Currently the gfortran compiler provided by this brew is only supports the following versions of XCode:

    - XCode 3.1.4 on OS X 10.5.x
    - XCode 3.2.2/3.2.3 -- 4.0 on OS X 10.6.x
    - XCode 4.1 or newer on OS X 10.7.x

The AppStore and Software Update can help upgrade your copy of XCode.
The latest version of XCode is also available from:

http://developer.apple.com/technologies/xcode.html

这使我想到了一个博客文章： http : //www.joewandy.com/ 。 我遵循了此建议：

该命令：

brew edit gfortran

将使用xcode打开文件。 我在两个地方修改了该文件：

论文2行：

if MacOS.xcode_version >= '4.2' and MACOS_VERSION == 10.7
    ohai "Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666)"

变成：

if MacOS.xcode_version >= '4.2' and MACOS_VERSION >= 10.7
    ohai "Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666) or higher"

换一种说法：

将== 10.7更改为>= 10.7并将XCode 4.2 (build 5666)更改为XCode 4.2 (build 5666) or higher

然后我做了

brew install gfortran

再次。 消息成功：

Downloading http://r.research.att.com/tools/gcc-42-5666.3-darwin11.pkg

Already downloaded: /Library/Caches/Homebrew/gfortran-4.2.4-5666.3.pkg
==> Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666) or higher
==> Caveats
Brews that require a Fortran compiler should not use:

depends_on 'gfortran'

The preferred method of declaring Fortran support is to use:

def install
    ...
    ENV.fortran
    ...
end

==> Summary

/usr/local/Cellar/gfortran/4.2.4-5666.3: 86 files, 72M, built in 2 seconds

然后我做了：

pip install scipy

但这给了我这个：

#error "<vecLib/vecLib.h> is deprecated.  Please #include <Accelerate/Accelerate.h> and link to Accelerate.framework."

然后我找到了此博客文章：在Mountain Lion上编译SciPy http://www.thisisthegreenroom.com/2012/compiling-scipy-on-mountain-lion/

表示要使用此命令：

pip install -e git+https://github.com/scipy/scipy#egg=scipy-dev

这大约需要5到6分钟才能完成

Installed /Users/hernamesbarbara/src/scipy
Successfully installed scipy
Cleaning up...

之后我可以做

python


Python 2.7.3 (v2.7.3:70274d53c1dd, Apr  9 2012, 20:52:43) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import scipy
>>> help(scipy)

    Help on package scipy:

NAME
    scipy

成功！

已安装SciPy版本：

full_version = '0.12.0.dev-14b1e07'
git_revision = '14b1e07602ff33a6e8250eb2bc7a6816677606a9'
release = False
short_version = '0.12.0'
version = '0.12.0.dev-14b1e07'

Answer 3

我认为您不需要安装Brew和XCode，也不需要自己编译gfortran：我从http://hpc.sourceforge.net安装了gfortran的编译版本，一切似乎都可以正常工作。 （我是10.7.5）