皮爾森的相關性測試

Question

我有這樣的情況：

Gene       SAMPLE1   SAMPLE2 
 G1         0.33      0.21  
 G2         0.45      0.324 
 G3         0.765     0.654 
 G4         0.98      0.543 
 G5         0.565     0.13
 G6         0.123     0.943
 G7         0.321     0.572
....       ...       ......

數據不是真實數據。 我需要：計算雙面Pearson相關性檢驗的p值。

有人可以幫我嗎？ 我是R的新人

Answer 1

您可以使用cor.test來執行此相關性測試。 這是任何標准R分發的一部分。 在您的情況下with(dat, cor.test(Sample1, Sample2))將執行您需要的測試。

谷歌搜索R correlation test返回cor.test的文檔作為第一個結果。

Answer 2

如上所述，您可以使用cor.test（）函數：

 cor.test(data$SAMPLE1, data$SAMPLE2)

如果您是R的初學者，則在此廣泛描述兩個變量之間的相關性測試：

http://www.sthda.com/english/wiki/correlation-test-between-two-variables

您也可以在線進行pearson相關測試，無需任何安裝：

http://www.sthda.com/english/rsthda/correlation.php