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[英]Extract all possible combinations of rows with unique values in a variable
我正在嘗試對一個數據集進行薈萃分析,其中多個作者進行了多項研究,這可能會導致偏差。 因此,我想提取所有可能的行組合,其中任何Author都出現一次。 樣本數據: 並希望提取每個作者出現一次的所有可能的行組合(在本例中為 4 種可能性)。 最后,我將對這 4 個不同的提取數據幀進行分析,但我不知道如何 ...
[英]Extract all possible combinations of rows with unique values in a variable
我正在嘗試對一個數據集進行薈萃分析,其中多個作者進行了多項研究,這可能會導致偏差。 因此,我想提取所有可能的行組合,其中任何Author都出現一次。 樣本數據: 並希望提取每個作者出現一次的所有可能的行組合(在本例中為 4 種可能性)。 最后,我將對這 4 個不同的提取數據幀進行分析,但我不知道如何 ...
[英]Funnel plot with effective sample size in R
我打算創建一個具有有效樣本量的漏斗 plot。 我正在使用 metafor package 的funnel.default() metafor我嘗試了以下代碼來創建這樣一個漏斗 plot 但是這段代碼給我返回了一個錯誤,如下所示 有誰知道如何處理這個錯誤? ...
[英]How do i predict one of the moderator variables in my linear meta-regression?
我在 metafor package 中創建了一個線性元回歸: 我可以使用以下 function 預測給定 LVEF 的 LnRR: 如何估算給定 LnRR 的 LVEF? 謝謝! ...
[英]Fitting a long list of studies in Metafor Forestplot to make it readable
我正在嘗試使用 metafor::forest 做一個森林 plot。 問題是因為我有超過 100 項研究,所以 output 是不可讀的,因為行混合在一起並重疊,除非我選擇非常小的字體(在這種情況下你也無法閱讀它)。 關於如何 plot 的任何想法,以便字體足夠大以便在所有行不重疊的情況下閱讀? ...
[英]95% confidence intervals and SE calculated by meta package are different from the original data
我的願望是使用 meta r 包的森林函數在森林圖中呈現 OR 和 95% 置信區間。 這是一項非薈萃分析任務。 但是,當在森林圖中繪制時,提供的置信區間會發生變化。 例如,您可以看到以下內容 運行上面的代碼后,我得到以下圖。 如您所見,計算出的 seTE(標准誤差)與您使用公式 SE =(上限 ...
[英]How to create a funnel plot where the same color indicates effect sizes from the same studies
我正在嘗試在 metafor 中創建一個funnel plot metafor測試是否存在發表偏倚。 在漏斗 plot 中,我試圖創建相同的顏色來指示來自相同研究的效果大小。 我最近看到一篇論文,他們使用以下代碼應用了相同的方法: 我只是想知道inferno(25)[pos]在參數col中意味着什么 ...
[英]How to change dots in forest plot?
我有一個 excel 表,其中包含我研究的不同疾病的優勢比數據。 我想用 R package ggplot2 制作森林圖。我用過這個腳本: 這為所有疾病制作了圓形黑點。我想將圖表上的點的形狀更改為正方形或其他不同形式,但僅限於某些疾病。 我想更改圖表上對應於第 6、8、14 和 16 行的點的形狀 ...
[英]How do I create a forest plot of leave one out analysis on metafor?
我能夠使用命令獲得遺漏分析的結果 leave1out(res,transf = exp) 但是我如何從這里構建一個森林 plot 呢? 謝謝 ...
[英]R: Reiterate command metafor:rma using a loop
我正在使用 metafor package 和 rma.glmm function 對比例進行元分析。 由於我的數據集很大,有很多變量,我想通過 dataframe 的一些列來重申 rma.glmm function。 這是 dataframe: 我寫了以下代碼: 我收到以下錯誤: ni - xi ...
[英]how to interpret robustness result
我使用 metafor 運行了一個多元元分析來解釋效應大小的依賴關系,然后我還使用metafor的robust metafor應用了穩健性檢查。 但是,我不確定我應該如何解釋這種穩健性檢查的結果。 有人能幫忙嗎? 以下是多元薈萃分析的結果 這是穩健性檢查的結果 ...
[英]Decimal places in annotations of forest plots generated with the metafor package
在之前一篇關於使用 metafor package 生成的森林圖中顯示的有效數字的文章中,建議使用選項digits來指定 x 軸的刻度標記標簽和 plot 注釋的小數位數。 是否可以為注釋的不同部分指定不同的小數位數,即權重為 1 位小數,效應大小為多於 1 位小數,如果可以,如何? ...
[英]writing ouput from anova.rma(metafor) to a csv or dataframe
我已經從 metafor package 中完成了多個 anova.rma 函數,以比較元分析中的 2 級和 3 級模型,控制台中的 output 是一個不錯的表。 我想把它寫到 csv 以便我可以存儲這些結果,但是保存在環境中的 object 是一個列表,我在實際寫這個 output 時遇到了麻 ...
[英]Error during wrapup: Length of the 'slab' argument (28) does not correspond to the number of outcomes (24)
我正在嘗試使用 metafor 為子組分析生成森林metafor 。 創建森林plot的代碼如下: 但是當我運行代碼時,我收到了這個錯誤 有誰知道如何糾正這個錯誤? 事先謝謝你 ...
[英]Error during wrapup: Number of parameters to be estimated is larger than the number of observations
我正在metafor package 中運行元回歸分析,我的代碼如下 當我運行此代碼時,出現以下錯誤 但是當我從 model 中刪除“annual_temp”時,它運行完美。 我不確定是什么問題。 “annual_temp”是一個連續變量。 您能否建議我如何解決此錯誤? 提前致謝 ...
[英]Using predict in metafor when each author has multiple rows in the data
我正在使用 metafor package 進行元分析,我對 X 對年齡對棲息地利用的影響(原始平均值和方差)的影響感興趣。 我的一個模型的一個例子是: 我不使用 Citation 作為隨機效應的理由是,與random = list( ~ 1 | Citation/ID, ~ 1 | Region ...
[英]How to change point color of forest plot in metafor()
我有一個使用 metafor::forestplot() 構建的森林圖,我想根據具有兩個級別(dat$target_status = 'targeted' 或 'nontargeted')的分組變量為點和 CI 着色。 將顏色通過向量傳遞到 forest() 'col' 對我不起作用。 以下代碼更改 ...
[英]ClubSandwich::conf_int in meta-analysis - SE formula does not give the same CIs
所以我使用 metafor (rma.mv) 和 clubSandwich 來計算 CHE 模型元分析,但是當我使用 clubSandwich::conf_int 函數來估計我的集群穩健的 SE 和 CI 時,我注意到 CI 中存在一些差異。使用 SE 以通常的方式計算它們(lnOR +/- (1. ...
[英]how to show the overall summary in a forest plot exponantiated?
我正在 R 中運行元分析,其中在 logHR 中給出了總結措施。 數據如下 我的問題是如何使森林 plot 顯示置信區間為 HR 而不是 logHR 的結果? ...
[英]metafor:Forest removing or moving metaestimate column
我正在嘗試更改我的森林圖的格式以准備出版。 我想移動顯示當前效果估計的最右側列(在我的情況下為優勢比)。 該列是固定在圖的右側還是可以移動以使其與其他列對齊並且森林圖本身位於最右側。 這是我當前的森林情節代碼 這給出了這個情節 我想將 ODDS RATIO 列移動到 diff[95 CI] ...
[英]R returns partial (incomplete) results from function
我嘗試比較使用包metafor (rma.mv- 或 rma - 函數)計算的元分析中的模型。 我嘗試編寫一個函數,從i模型中提取特定值(這里:只是 beta 和標准錯誤)並將它們添加到數據框中。 我的問題是模型結果最終不會作為數據或數據框。 標題重復每一行。 當我將結果轉換為對象並嘗試調用它時, ...