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有没有办法在不忽略标记的情况下在 spatstat 中执行 quadratcount()? - Is there a way to perform quadratcount() in spatstat without ignoring the marks?

想象一下,我在一个正方形中有一个点模式分布,并且所有点都有标记(即植物性状数据)。 我想把这个正方形分成 fe 4 个样方。 现在我对特征的空间分布感兴趣,即我现在需要知道哪个特征出现在哪个样方中。 在这种情况下,仅计算每个样方的点数无济于事,我需要知道点数 + 标记。 但是,quadratcou ...

错误:给出了 x、y 坐标但未指定 window (spatstat) - Error: x,y coords given but no window specified (spatstat)

我正在生成一个随时间演变的景观模式。 代码的问题是我已经为 object 明确定义了一个 window 来引发错误,但是 window 没有被识别。 我也看不出有什么点落在 window 之外,或者这会有什么不同。 但是,当我运行时: 我收到错误: 为什么会这样? ...

2023-01-10 19:30:16   1   23    r / spatstat  
模拟R spatstat中的kppm对象列表 - Simulate a list of kppm objects in R spatstat

我想在 kppm 对象列表上使用包络模拟。 我有一个网格模式的点数据集。 我想移动每个点,使其在单元格中的 position 是随机的,然后运行 spatstat 模拟以确定这些点是否随机分布(显然将在子单元格大小范围内)。 然后随机移动单元内的每个点,并重新运行模拟 - 重复 n 次并生成所有模拟 ...

寻找使用`linearKEuclid`和`spatstat`的相应功能的方法 - Searching for a way to use `linearKEuclid` and corresponding functions of `spatstat`

我的目标是分析线性网络上关于欧几里得距离的简单点模式,而不是在linearK中实现的最短路径距离以及spatstat及其子包的相关函数。 浏览 web 我在这里找到了名为 function linearKEuclid()和相关函数的有前途的函数。 不幸的是,我无法在我的 Win 机器上使用这些功能, ...

2022-09-15 09:26:12   1   25    r / spatstat  
Append spatstat 跨镶嵌表面(源自 shapefile)的强度输出返回到 SpatialPolygonsDataFrame 以在 R 中绘图 - Append spatstat intensity outputs across tesselated surface (derived from shapefile) back to SpatialPolygonsDataFrame for plotting in R

有人建议在转换为 owin object 以在 Spatstat 中进行模式分析后从空间多边形数据框中保留(或附加)属性吗? 使用 spatstat 计算镶嵌曲面上的点强度。 没有问题,除了当我将空间多边形数据框转换为 owin object(以及随后的 tess 对象)时丢失了多边形标签。 请参阅 ...

创建相关标记。 例如点大小随点间距离而变化 - Creation of correlated marks. e.g. point sizes varying with inter-point distances

我最近涉足点模式分析,想知道是否有任何标准做法可以创建随点位置的点间距离而变化的标记相关结构。 显然,我了解如何模拟独立标记,正如经常提到的那样,例如 在此处输入图像描述更一般地说,假设我们有相当数量的点,例如在任意观察 window(例如矩形)中坐标 x 和 y 的 n=100。 每个点都有一个特 ...

2022-09-07 08:25:23   1   28    r / spatstat  
计算 dplyr 中分组数据的加权中位数的 95% 置信区间 - Calculating 95% confidence intervals for a weighted median over grouped data in dplyr

我有一个包含多个组的数据集,我想使用 dplyr 计算每个组的中值。 数据是加权的,在计算中位数时需要考虑权重。 我从spatstat找到了weighted.median function 似乎工作正常。 考虑以下简化示例: 但是,我还想为这些值添加 95% 的置信区间,这让我很困惑。 我考虑过的事 ...

分析栅格图层的像素分布 - Analyse Pixel distribution of a Rasterlayer

我真的很需要一些建议。 我有一个有很多像素的光栅。 每个像素都有一个值。 现在我想对这些像素进行空间分析。 我想看看哪个区域的像素最多而没有。 听起来很简单,但事实并非如此。 我有一个想法用内核密度来做到这一点,但它不适用于光栅层。 它也不适用于 ppp,因为您无法将栅格转换为这种数据类型。 我真 ...

spatstat 中点过程 model 中协变量的平滑部分残差 - Smoothed partial residuals of a covariate in a point process model in spatstat

我正在使用spatstat使用ppm function 构建点过程模型,但是当我使用残差 plot parres来理解协变量的影响时,我在验证中遇到了问题。 model 由 1022 个鸟类出现位置(称为ois.ppm )、栖息地可用性(称为FB0lin的栅格已标准化和对数转换)、采样工作量(称为 ...


 
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